More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3965 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3315  Pirin domain protein  99.42 
 
 
347 aa  702    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3965  pirin domain-containing protein  100 
 
 
347 aa  705    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal  0.318513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0908  pirin domain-containing protein  78.11 
 
 
348 aa  545  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4605  pirin domain-containing protein  71.8 
 
 
349 aa  480  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.738915  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3993  pirin domain-containing protein  67.25 
 
 
366 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347304  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4775  Pirin-like  67.84 
 
 
363 aa  455  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.054663  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5250  Pirin domain protein  67.54 
 
 
390 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00018028  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2659  pirin domain-containing protein  55.69 
 
 
335 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.12893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6112  Pirin domain protein  57.61 
 
 
339 aa  365  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3130  hypothetical protein  51.03 
 
 
338 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.828286  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2634  pirin domain-containing protein  50.88 
 
 
339 aa  353  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00219854  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0441  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.54 
 
 
348 aa  333  3e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34715  predicted protein  48.1 
 
 
352 aa  311  9e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.343605  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29089  predicted protein  50.95 
 
 
335 aa  311  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  39.51 
 
 
288 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  39.51 
 
 
288 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  42.32 
 
 
288 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  39.09 
 
 
288 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  34.82 
 
 
286 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  39.09 
 
 
290 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  40.08 
 
 
288 aa  157  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  39.09 
 
 
288 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  38.11 
 
 
288 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  39.09 
 
 
288 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  39.69 
 
 
293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  39.34 
 
 
288 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  38.75 
 
 
290 aa  150  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  38.59 
 
 
288 aa  149  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  38.75 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  38.75 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  38.75 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  38.75 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  35.89 
 
 
286 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  35.89 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  35.89 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  35.89 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  38.75 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  38.75 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  38.75 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  37.5 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  35.89 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  38.75 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  38.65 
 
 
293 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  37.5 
 
 
289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  33.89 
 
 
282 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  37.85 
 
 
286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  38.33 
 
 
305 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  37.5 
 
 
289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  37.5 
 
 
289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  37.45 
 
 
286 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  39.75 
 
 
287 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  38.62 
 
 
279 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  37.65 
 
 
286 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  37.45 
 
 
286 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  37.1 
 
 
293 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  40 
 
 
295 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  39.18 
 
 
299 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  38.37 
 
 
293 aa  142  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  37.3 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  37.92 
 
 
295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  35.18 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  38.75 
 
 
291 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  33.2 
 
 
287 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  37.3 
 
 
288 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  33.79 
 
 
287 aa  139  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  38.96 
 
 
290 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  34.52 
 
 
294 aa  139  7e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  33.61 
 
 
289 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  37.85 
 
 
286 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  36.63 
 
 
286 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  36.36 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  37.5 
 
 
290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  38.55 
 
 
290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  38.55 
 
 
290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  39.84 
 
 
284 aa  136  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  37.7 
 
 
290 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  37.16 
 
 
299 aa  136  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  35.08 
 
 
288 aa  135  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  34.96 
 
 
324 aa  135  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  36.25 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  37.7 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  35.98 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3217  pirin domain-containing protein  38.06 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  35.6 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  34.9 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  36.99 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6985  Pirin domain protein  32.94 
 
 
287 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16689  hitchhiker  0.00000014497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  37.05 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  37.14 
 
 
290 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  37.14 
 
 
290 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  37.14 
 
 
290 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  36.73 
 
 
284 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  32.14 
 
 
293 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  36.89 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  31.67 
 
 
282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  33.84 
 
 
312 aa  133  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  32.45 
 
 
303 aa  132  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  37.14 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  37.14 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  37.14 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>