More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6112 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6112  Pirin domain protein  100 
 
 
339 aa  679    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3130  hypothetical protein  54.52 
 
 
338 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.828286  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3993  pirin domain-containing protein  62.13 
 
 
366 aa  418  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347304  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5250  Pirin domain protein  59.36 
 
 
390 aa  398  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00018028  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4605  pirin domain-containing protein  60.95 
 
 
349 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.738915  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2659  pirin domain-containing protein  55.18 
 
 
335 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.12893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4775  Pirin-like  56.73 
 
 
363 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.054663  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0908  pirin domain-containing protein  57.88 
 
 
348 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2634  pirin domain-containing protein  52.54 
 
 
339 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00219854  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0441  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  52.57 
 
 
348 aa  368  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3965  pirin domain-containing protein  57.61 
 
 
347 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal  0.318513 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3315  Pirin domain protein  57.61 
 
 
347 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34715  predicted protein  52.63 
 
 
352 aa  344  1e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.343605  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29089  predicted protein  47.6 
 
 
335 aa  291  1e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  38.75 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  40.56 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  39.34 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  39.34 
 
 
288 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  39.34 
 
 
288 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  40.91 
 
 
290 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  40.91 
 
 
290 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  40.91 
 
 
290 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  38.68 
 
 
288 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  38.68 
 
 
288 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  40.91 
 
 
290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  40.91 
 
 
290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  40.91 
 
 
290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  38.27 
 
 
288 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  37.34 
 
 
293 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  37.5 
 
 
305 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  39.76 
 
 
287 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  38.06 
 
 
296 aa  142  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  36.21 
 
 
285 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  37.19 
 
 
289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  37.19 
 
 
289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  37.19 
 
 
289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  37.5 
 
 
288 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  37.5 
 
 
288 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  36.25 
 
 
286 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  36.25 
 
 
286 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  37.5 
 
 
288 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  38.11 
 
 
290 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  37.5 
 
 
288 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  37.5 
 
 
288 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  36.25 
 
 
286 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  37.5 
 
 
288 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  37.5 
 
 
288 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  36.25 
 
 
286 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  37.5 
 
 
295 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  36.93 
 
 
284 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  36.25 
 
 
286 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  34.83 
 
 
282 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  36.67 
 
 
290 aa  139  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  36.07 
 
 
288 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  39.67 
 
 
290 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  32.65 
 
 
282 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  39.92 
 
 
292 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  34.43 
 
 
286 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  36.48 
 
 
288 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  37.76 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  38.96 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  37.86 
 
 
291 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  33.86 
 
 
283 aa  136  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  38.78 
 
 
290 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  37.4 
 
 
288 aa  136  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  40.74 
 
 
290 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  37.08 
 
 
295 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0892  Pirin domain protein  38 
 
 
285 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  37.5 
 
 
286 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  37.08 
 
 
295 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  32.92 
 
 
287 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  37.25 
 
 
293 aa  135  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3469  pirin domain-containing protein  37.35 
 
 
285 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  37.55 
 
 
299 aa  135  9e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  34.04 
 
 
284 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  37.76 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  39.51 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  38.74 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  36.21 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  38.96 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  34.72 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  34.41 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  35.07 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  35.1 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  34 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  34.47 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  37.05 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0867  pirin domain-containing protein  37.6 
 
 
285 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  33.46 
 
 
287 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  37.3 
 
 
288 aa  134  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0902  pirin domain-containing protein  37.89 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  34.57 
 
 
285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  38.49 
 
 
303 aa  133  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  37.5 
 
 
286 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  31.4 
 
 
293 aa  133  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  35.08 
 
 
286 aa  132  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  39.27 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  37.45 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  36.36 
 
 
286 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  37.86 
 
 
292 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>