More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0441 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0441  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  100 
 
 
348 aa  721    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3130  hypothetical protein  49.4 
 
 
338 aa  371  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.828286  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6112  Pirin domain protein  52.57 
 
 
339 aa  360  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2634  pirin domain-containing protein  50.74 
 
 
339 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00219854  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3993  pirin domain-containing protein  47.52 
 
 
366 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347304  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0908  pirin domain-containing protein  48.35 
 
 
348 aa  330  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3315  Pirin domain protein  49.85 
 
 
347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3965  pirin domain-containing protein  49.54 
 
 
347 aa  325  6e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal  0.318513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5250  Pirin domain protein  47.66 
 
 
390 aa  323  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00018028  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2659  pirin domain-containing protein  44.85 
 
 
335 aa  322  5e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.12893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4775  Pirin-like  45.88 
 
 
363 aa  318  6e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.054663  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4605  pirin domain-containing protein  47.42 
 
 
349 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.738915  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34715  predicted protein  44.89 
 
 
352 aa  293  2e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.343605  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29089  predicted protein  45.11 
 
 
335 aa  287  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  40.82 
 
 
288 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  41.22 
 
 
288 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  41.22 
 
 
288 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  41.39 
 
 
288 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  41.39 
 
 
288 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  40.73 
 
 
288 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  40.73 
 
 
288 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  40.73 
 
 
288 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  40.73 
 
 
288 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  41.91 
 
 
295 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  40.73 
 
 
288 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  40.73 
 
 
288 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  40.73 
 
 
288 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  40.82 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  39.92 
 
 
288 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  42.74 
 
 
291 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  40 
 
 
288 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  41.49 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  40.48 
 
 
293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  41.56 
 
 
287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  40 
 
 
293 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  40.66 
 
 
295 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  40.65 
 
 
288 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  38.11 
 
 
284 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  39.67 
 
 
288 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  40.98 
 
 
289 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  40.98 
 
 
289 aa  157  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  40.98 
 
 
289 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  37.9 
 
 
293 aa  155  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  39.43 
 
 
286 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  39.43 
 
 
286 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  39.43 
 
 
286 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  39.43 
 
 
286 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  40.08 
 
 
286 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  39.43 
 
 
286 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  40.49 
 
 
286 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  39.27 
 
 
293 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  38.11 
 
 
292 aa  153  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  39 
 
 
288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  39.68 
 
 
286 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  40.71 
 
 
299 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  36.84 
 
 
294 aa  152  8.999999999999999e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  38.58 
 
 
298 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4059  Pirin domain protein  38.59 
 
 
290 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  38.08 
 
 
288 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  38.33 
 
 
287 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  37.3 
 
 
298 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  38.78 
 
 
290 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  38.78 
 
 
290 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  38.78 
 
 
290 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  36.73 
 
 
283 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  34.16 
 
 
303 aa  149  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  36.97 
 
 
290 aa  149  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  37.35 
 
 
288 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  34.41 
 
 
303 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  38.37 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  38.37 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  36.29 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  38.37 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  36.67 
 
 
290 aa  146  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  36.43 
 
 
282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  38 
 
 
290 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  37.76 
 
 
284 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  36.99 
 
 
318 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  36.64 
 
 
312 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  38.43 
 
 
293 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  38.43 
 
 
290 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  36.51 
 
 
298 aa  142  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  33.2 
 
 
285 aa  142  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  34.92 
 
 
307 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  37.19 
 
 
290 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  38 
 
 
290 aa  142  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  35.68 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  35.15 
 
 
286 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  39.26 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  33.7 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  37.19 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  37.19 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  36.59 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  34.3 
 
 
284 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  37.55 
 
 
337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6985  Pirin domain protein  36.78 
 
 
287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16689  hitchhiker  0.00000014497 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  35.5 
 
 
285 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  33.06 
 
 
287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  37.82 
 
 
284 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  37.34 
 
 
279 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>