More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2634 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2634  pirin domain-containing protein  100 
 
 
339 aa  705    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00219854  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3130  hypothetical protein  55.79 
 
 
338 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.828286  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3993  pirin domain-containing protein  52.05 
 
 
366 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347304  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6112  Pirin domain protein  52.54 
 
 
339 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2659  pirin domain-containing protein  51.81 
 
 
335 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.12893 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0441  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.74 
 
 
348 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5250  Pirin domain protein  51.61 
 
 
390 aa  358  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00018028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0908  pirin domain-containing protein  50 
 
 
348 aa  353  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3315  Pirin domain protein  50.88 
 
 
347 aa  348  8e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4775  Pirin-like  48.68 
 
 
363 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.054663  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3965  pirin domain-containing protein  50.88 
 
 
347 aa  346  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal  0.318513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4605  pirin domain-containing protein  49.71 
 
 
349 aa  345  6e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.738915  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29089  predicted protein  46.63 
 
 
335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34715  predicted protein  47.52 
 
 
352 aa  304  2.0000000000000002e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.343605  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  35.48 
 
 
288 aa  151  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  33.33 
 
 
293 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  37.25 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  37.25 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  37.25 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  33.33 
 
 
286 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  33.33 
 
 
286 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  32.41 
 
 
288 aa  143  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  33.33 
 
 
286 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  33.33 
 
 
286 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  32.06 
 
 
293 aa  142  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42930  predicted protein  33.33 
 
 
311 aa  142  9e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  32.99 
 
 
286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  33.33 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  31.03 
 
 
288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  36.03 
 
 
284 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  35.54 
 
 
290 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  35.56 
 
 
290 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  31.62 
 
 
288 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  35.68 
 
 
287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  34.16 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  35.27 
 
 
305 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  38.37 
 
 
285 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  36.21 
 
 
288 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  30.24 
 
 
290 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  32.17 
 
 
288 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  32.17 
 
 
288 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  34.02 
 
 
283 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  35.74 
 
 
293 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  32.17 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  33.46 
 
 
288 aa  136  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  35.54 
 
 
290 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  31.71 
 
 
293 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  33.2 
 
 
292 aa  137  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  31.45 
 
 
288 aa  136  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  35.34 
 
 
284 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  31.09 
 
 
288 aa  135  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  34.02 
 
 
290 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  34.82 
 
 
293 aa  135  9e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  32.4 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  35.54 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  35.54 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  32.06 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4059  Pirin domain protein  32.54 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  36.73 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  35.54 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  34.44 
 
 
295 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  35.8 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  35.8 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  35.8 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  35.8 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  35.8 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  35.8 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  33.33 
 
 
286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  35.08 
 
 
294 aa  133  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  31.31 
 
 
286 aa  132  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  35.12 
 
 
290 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  32.35 
 
 
285 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  32.93 
 
 
286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  33.88 
 
 
304 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  30.56 
 
 
288 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  34.94 
 
 
292 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  32.92 
 
 
284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  30.9 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  30.9 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  35.54 
 
 
337 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  30.9 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  30.9 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  30.9 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  31.28 
 
 
293 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  30.9 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  33.86 
 
 
298 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  33.47 
 
 
287 aa  129  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0747  pirin domain-containing protein  33.71 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.989283  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  32.36 
 
 
294 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  34.96 
 
 
324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  32.64 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  34.44 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  31.07 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  30.8 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  33.73 
 
 
290 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  32.84 
 
 
346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  35.66 
 
 
290 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  35.66 
 
 
290 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  34.2 
 
 
337 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  33.86 
 
 
298 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>