40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_19710 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_19710  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  598  1e-170  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0401  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.29 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4454  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.49 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000618173 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0009  DNA polymerase III, epsilon subunit  22.73 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0223  exonuclease  30.82 
 
 		 163 aa  65.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1529  DNA polymerase III, epsilon subunit related 3'-5' exonuclease  25.88 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2129  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2578  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28.42 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0358543  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4078  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.37 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0370  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.14 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0325  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.92 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0902  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.39 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08390  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  31.97 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.69329  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2310  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.14 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167854 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0402  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  25.6 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000167602  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1663  DNA polymerase III, epsilon subunit or related 3'-5' exonuclease  24.29 
 
 		 177 aa  58.9  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0330  exonuclease  27.84 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1688  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.61 
 
 		 186 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.609877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2865  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3-5 exonuclease  26.19 
 
 		 207 aa  53.1  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161368  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2838  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.35 
 
 		 199 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.507206  hitchhiker  0.0093058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2577  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.35 
 
 		 196 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.181188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1294  DNA polymerase III, epsilon subunit related 3'-5' exonuclease  23.89 
 
 		 177 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0141  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.01 
 
 		 177 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000727822  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1582  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.41 
 
 		 176 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0492  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.61 
 
 		 189 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.6637  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0024  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.38 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13734 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1746  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.03 
 
 		 280 aa  46.6  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.11 
 
 		 921 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2024  Rad3-related DNA helicase  26.51 
 
 		 791 aa  46.2  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3096  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  23.7 
 
 		 201 aa  46.2  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.316534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1394  DNA polymerase III subunit epsilon  19.23 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00500752  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1655  DNA polymerase III subunit epsilon  19.78 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2432  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.93 
 
 		 164 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000167398  hitchhiker  0.000000855103 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0132  exonuclease  25.61 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0049  DNA-directed DNA polymerase  28.74 
 
 		 208 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00111641  normal  0.175204 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3293  exonuclease  28.95 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.413977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0478  DNA polymerase III, epsilon subunit  21.69 
 
 		 184 aa  42.7  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.31 
 
 		 695 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0768  exonuclease  27.04 
 
 		 207 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0010  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.57 
 
 		 289 aa  42.4  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>