123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1741 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1741  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0228  hypothetical protein  39.77 
 
 
254 aa  184  9e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.276691  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  33.15 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1068  hypothetical protein  30.34 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0896  hypothetical protein  31.61 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0037  hypothetical protein  28.5 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1624  hypothetical protein  29.18 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  35.56 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1289  protein of unknown function DUF34  28.69 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.146392  normal  0.550542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  41.84 
 
 
377 aa  69.3  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1050  hypothetical protein  29.89 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.277421  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  37.98 
 
 
278 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0258  hypothetical protein  31.21 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.94449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  28.32 
 
 
278 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  36.25 
 
 
290 aa  63.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  33.33 
 
 
366 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1515  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  32.89 
 
 
273 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  32.63 
 
 
318 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0272  hypothetical protein  26.18 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.492369  normal  0.547542 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  31.51 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  39.18 
 
 
371 aa  59.3  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  32.35 
 
 
372 aa  59.3  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  26.24 
 
 
249 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  29.23 
 
 
286 aa  58.9  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  31.07 
 
 
269 aa  58.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0750  hypothetical protein  29.78 
 
 
280 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000399677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  34.38 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  36.08 
 
 
374 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  35.05 
 
 
370 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01348  hypothetical protein  33.87 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  33.78 
 
 
262 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  32.69 
 
 
296 aa  56.2  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  23.56 
 
 
262 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  34.51 
 
 
375 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  33.95 
 
 
286 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  23.56 
 
 
262 aa  55.8  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  33.63 
 
 
371 aa  55.5  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  38.71 
 
 
373 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004118  hypothetical protein  33.87 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  35.83 
 
 
373 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  36.84 
 
 
388 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  37.07 
 
 
361 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  34.34 
 
 
372 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  30.67 
 
 
257 aa  53.1  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  36.36 
 
 
373 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  34.34 
 
 
372 aa  52  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2403  hypothetical protein  31.52 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.103164 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1271  hypothetical protein  29.28 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.610569  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  35.22 
 
 
287 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3106  protein of unknown function DUF34  30.69 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  33.33 
 
 
380 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1729  hypothetical protein  31.2 
 
 
330 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  25.2 
 
 
263 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2210  hypothetical protein  25.49 
 
 
251 aa  49.3  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1679  hypothetical protein  30.91 
 
 
256 aa  49.3  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00563581  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1225  putative hydrolase-oxidase  26.03 
 
 
247 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  26.25 
 
 
262 aa  49.3  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0663  hypothetical protein  32.74 
 
 
251 aa  49.3  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  35.19 
 
 
368 aa  49.3  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  34.02 
 
 
366 aa  49.3  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  36.22 
 
 
384 aa  48.9  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  34.02 
 
 
373 aa  48.5  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  28.95 
 
 
372 aa  48.5  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  25.6 
 
 
274 aa  48.5  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0840  hypothetical protein  31.9 
 
 
251 aa  48.5  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  32.09 
 
 
393 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3111  putative hydrolase-oxidase  25.52 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  43.1 
 
 
372 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  35.29 
 
 
373 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  26.85 
 
 
306 aa  46.6  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09950  hypothetical protein  27.63 
 
 
291 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000349861  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  33.56 
 
 
287 aa  47  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2931  hypothetical protein  31.45 
 
 
248 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  30.23 
 
 
369 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2667  hypothetical protein  31.45 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0440  hypothetical protein  31.45 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0023  hypothetical protein  30.7 
 
 
252 aa  46.2  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102702  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0419  hypothetical protein  31.45 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201589 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  22.6 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  24.76 
 
 
262 aa  46.2  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2699  hypothetical protein  30.83 
 
 
284 aa  45.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0742132  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  35.64 
 
 
381 aa  45.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2230  hypothetical protein  27.16 
 
 
251 aa  45.8  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0822184  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0917  protein of unknown function DUF34  25.95 
 
 
249 aa  45.4  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  26.38 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2923  protein of unknown function DUF34  29.2 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0444  hypothetical protein  28.83 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.427722  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1137  protein of unknown function DUF34  28.91 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3208  protein of unknown function DUF34  31.45 
 
 
248 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  29.79 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2001  hypothetical protein  30.09 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0358  hypothetical protein  29.84 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388987  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1695  protein of unknown function DUF34  27.61 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131996 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  34.41 
 
 
373 aa  43.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1438  hypothetical protein  33.72 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0367  hypothetical protein  29.84 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.465671 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  25 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12960  hypothetical protein  31.45 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>