88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0228 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0228  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  518  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.276691  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1741  hypothetical protein  39.77 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0896  hypothetical protein  29.83 
 
 
246 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1624  hypothetical protein  28.45 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1050  hypothetical protein  28.15 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.277421  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1068  hypothetical protein  29.83 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  27.12 
 
 
254 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  25.69 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  28.06 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  27.67 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0258  hypothetical protein  28.16 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.94449  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0037  hypothetical protein  26.22 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  27.73 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  26.72 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  22.61 
 
 
265 aa  62.8  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  27.71 
 
 
256 aa  62  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1289  protein of unknown function DUF34  25.1 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.146392  normal  0.550542 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  28.3 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0272  hypothetical protein  25.97 
 
 
240 aa  59.3  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.492369  normal  0.547542 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1515  hypothetical protein  26.38 
 
 
236 aa  59.3  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  25.75 
 
 
262 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  34.55 
 
 
373 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  30.16 
 
 
371 aa  58.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  26.74 
 
 
287 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  25.64 
 
 
262 aa  55.5  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  25.64 
 
 
262 aa  55.5  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  26.82 
 
 
286 aa  55.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  27.27 
 
 
310 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  31.45 
 
 
373 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  25.11 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  22.75 
 
 
274 aa  53.1  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  28.79 
 
 
290 aa  52.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0750  hypothetical protein  26.43 
 
 
280 aa  52  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000399677 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  28.12 
 
 
261 aa  52  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  24.9 
 
 
259 aa  52  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  29.59 
 
 
307 aa  52  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  24.62 
 
 
263 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  32.21 
 
 
275 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  27.04 
 
 
290 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  25.09 
 
 
290 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  24.46 
 
 
296 aa  49.3  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3419  SMS protein  25 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.645779  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  32.14 
 
 
374 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1825  SMS protein  24.62 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.496555  normal  0.125065 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  30.65 
 
 
373 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  25.84 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01899  NIF3  33.75 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.134254  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  20.16 
 
 
263 aa  47  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3112  hypothetical protein  23.83 
 
 
249 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22538  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  23.18 
 
 
255 aa  47  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  29.91 
 
 
373 aa  46.6  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  31.67 
 
 
377 aa  46.2  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  27.56 
 
 
372 aa  45.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01348  hypothetical protein  29.52 
 
 
252 aa  45.4  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  28.45 
 
 
371 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3201  protein of unknown function DUF34  25.71 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.266326  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  30.4 
 
 
373 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0096  hypothetical protein  27.45 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.387334  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1137  protein of unknown function DUF34  32.35 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  27.56 
 
 
373 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  34.65 
 
 
373 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0480  hypothetical protein  28.41 
 
 
248 aa  43.9  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.333005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  29.41 
 
 
372 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  27.42 
 
 
373 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1679  hypothetical protein  27.41 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00563581  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0806  hypothetical protein  34.33 
 
 
249 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.554338  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  31.07 
 
 
375 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1203  protein of unknown function DUF34  27.96 
 
 
259 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  29.6 
 
 
373 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  28.28 
 
 
318 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0840  hypothetical protein  31 
 
 
251 aa  42.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  28.3 
 
 
372 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0023  hypothetical protein  31.67 
 
 
252 aa  42.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102702  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  28.8 
 
 
373 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  24.9 
 
 
279 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  30.77 
 
 
372 aa  42.4  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  22.65 
 
 
264 aa  42.4  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  25.6 
 
 
287 aa  42.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3232  hypothetical protein  34.48 
 
 
248 aa  42.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  28.8 
 
 
373 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  28.8 
 
 
373 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  28.8 
 
 
373 aa  42.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  28.8 
 
 
373 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  28.8 
 
 
373 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0663  hypothetical protein  30.93 
 
 
251 aa  42  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  26.61 
 
 
373 aa  42  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2001  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  42  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2931  hypothetical protein  32.88 
 
 
248 aa  42  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>