252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0224 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0224  Holliday junction resolvase YqgF  100 
 
 		 135 aa  256  8e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.776353  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2951  Holliday junction resolvase YqgF  73.68 
 
 		 136 aa  196  7e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1778  Holliday junction resolvase YqgF  33.58 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.140554 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1032  Holliday junction resolvase YqgF  36.03 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0556  Holliday junction resolvase YqgF  34.59 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.901255  normal  0.0480752 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0470  Holliday junction resolvase YqgF  33.83 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000599692  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0088  Holliday junction resolvase YqgF  35.97 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1640  Holliday junction resolvase YqgF  36.57 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.278901  normal  0.163549 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05800  Holliday junction resolvase YqgF  29.32 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.209228  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2429  Holliday junction resolvase YqgF  32.12 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2570  Holliday junction resolvase YqgF  34.78 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00347975  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1790  Holliday junction resolvase YqgF  34.07 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00751815  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06155  Holliday junction resolvase-like protein  28.68 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0873  Holliday junction resolvase YqgF  32.86 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1438  Holliday junction resolvase YqgF  36.88 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2265  Holliday junction resolvase YqgF  32.84 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233904 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1491  Holliday junction resolvase-like protein  30.66 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000748947  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2633  Holliday junction resolvase-like protein  36.5 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2024  Holliday junction resolvase YqgF  35.94 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.330713  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2727  Holliday junction resolvase-like protein  36.5 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5430  Holliday junction resolvase YqgF  33.81 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2514  Holliday junction resolvase-like protein  35.88 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.36708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1942  Holliday junction resolvase-like protein  32.58 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1361  Holliday junction resolvase YqgF  35.07 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1969  Holliday junction resolvase-like protein  32.58 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0212683 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3713  Holliday junction resolvase YqgF  35.71 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0658941  hitchhiker  0.00476179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1768  Holliday junction resolvase-like protein  35.07 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0941  Holliday junction resolvase-like protein  35.07 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4051  Holliday junction resolvase YqgF  30.37 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789262 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2535  Holliday junction resolvase-like protein  36.03 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52249 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4148  Holliday junction resolvase YqgF  34.38 
 
 		 158 aa  60.1  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0925  Holliday junction resolvase YqgF  32.06 
 
 		 152 aa  60.1  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0074  Holliday junction resolvase YqgF  28.99 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.974882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2398  Holliday junction resolvase-like protein  32.82 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0366153  hitchhiker  0.00151496 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1232  Holliday junction resolvase-like protein  35.77 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2739  Holliday junction resolvase YqgF  29.71 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2911  Holliday junction resolvase YqgF  36.36 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.816073  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0938  Holliday junction resolvase YqgF  29.32 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2528  Holliday junction resolvase-like protein  26.81 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.551236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2239  Holliday junction resolvase-like protein  25.93 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2805  Holliday junction resolvase YqgF  33.33 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0775  Holliday junction resolvase YqgF  29.32 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000463594  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1714  Holliday junction resolvase-like protein  32.84 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.396791 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2047  Holliday junction resolvase YqgF  33.56 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4379  Holliday junction resolvase-like protein  32.82 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.556882  normal  0.251804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3098  Holliday junction resolvase-like protein  33.58 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0153  Holliday junction resolvase-like protein  29.71 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0185653  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0873  Holliday junction resolvase YqgF  36.15 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.205729  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1518  Holliday junction resolvase-like protein  32.84 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.793177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3347  Holliday junction resolvase-like protein  32.62 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1903  Holliday junction resolvase YqgF  27.94 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3562  Holliday junction resolvase-like protein  35.97 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329746  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0425  Holliday junction resolvase YqgF  42.22 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.585782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3225  Holliday junction resolvase YqgF  30.71 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0417  Holliday junction resolvase YqgF  28.37 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2202  Holliday junction resolvase-like protein  29.41 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0314  Holliday junction resolvase YqgF  33.08 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1976  Holliday junction resolvase YqgF  34.69 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.133397  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2554  Holliday junction resolvase YqgF  31.88 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0838  hypothetical protein  31.11 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.115372  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07810  conserved hypothetical protein TIGR00250  33.33 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0182311 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1191  Holliday junction resolvase YqgF  30.08 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000237997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0468  Holliday junction resolvase-like protein  32.31 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0094  Holliday junction resolvase YqgF  33.33 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0018567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3530  Holliday junction resolvase YqgF  31.88 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.390146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4996  Holliday junction resolvase-like protein  32.31 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2473  Holliday junction resolvase-like protein  30.77 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.641283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0474  Holliday junction resolvase YqgF  29.58 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00800439  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4870  Holliday junction resolvase-like protein  32.31 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0143218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5046  Holliday junction resolvase-like protein  32.31 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2479  Holliday junction resolvase-like protein  30 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0601  Holliday junction resolvase YqgF  29.77 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.613999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3633  Holliday junction resolvase YqgF  31.06 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5038  hypothetical protein  30.77 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0484  Holliday junction resolvase-like protein  30.77 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1130  Holliday junction resolvase YqgF  31.34 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0906  Holliday junction resolvase-like protein  32.06 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167999  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0061  Holliday junction resolvase YqgF  28.15 
 
 		 173 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.498043 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2406  Holliday junction resolvase YqgF  32.35 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.406379  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2641  Holliday junction resolvase YqgF  35.34 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0399  Holliday junction resolvase-like protein  34.62 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0597  Holliday junction resolvase-like protein  32.09 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1198  Holliday junction resolvase-like protein  30.5 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1269  Holliday junction resolvase-like protein  30.5 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000329275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1199  Holliday junction resolvase-like protein  30.5 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107111  normal  0.529497 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf203  putative Holliday junction resolvase  28.17 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3877  Holliday junction resolvase YqgF  29.2 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.843962  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0143  hypothetical protein  23.13 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.906758  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0056  hypothetical protein  28.15 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3892  Holliday junction resolvase-like protein  31.3 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3804  Holliday junction resolvase-like protein  32.03 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0796335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0915  Holliday junction resolvase YqgF  30.08 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.242003  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1336  Holliday junction resolvase-like protein  31.58 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164432  hitchhiker  0.000378103 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02779  Holliday junction resolvase-like protein  33.58 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.358182  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0563  Holliday junction resolvase-like protein  32.09 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5312  Holliday junction resolvase-like protein  31.06 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190801  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0765  Holliday junction resolvase-like protein  33.33 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809741  hitchhiker  0.0000191582 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3107  Holliday junction resolvase-like protein  33.33 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1154  Holliday junction resolvase YqgF  32.39 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0143  Holliday junction resolvase YqgF  30.08 
 
 		 177 aa  51.2  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>