269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2951 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2951  Holliday junction resolvase YqgF  100 
 
 		 136 aa  265  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0224  Holliday junction resolvase YqgF  73.68 
 
 		 135 aa  196  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.776353  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1778  Holliday junction resolvase YqgF  29.85 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.140554 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1640  Holliday junction resolvase YqgF  37.23 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.278901  normal  0.163549 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1032  Holliday junction resolvase YqgF  36.36 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0556  Holliday junction resolvase YqgF  33.33 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.901255  normal  0.0480752 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0470  Holliday junction resolvase YqgF  32.58 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000599692  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05800  Holliday junction resolvase YqgF  29.55 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.209228  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0425  Holliday junction resolvase YqgF  41.48 
 
 		 232 aa  67  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.585782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0775  Holliday junction resolvase YqgF  31.06 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000463594  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0941  Holliday junction resolvase-like protein  33.08 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2535  Holliday junction resolvase-like protein  35.61 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1768  Holliday junction resolvase-like protein  32.09 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06155  Holliday junction resolvase-like protein  30.88 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1438  Holliday junction resolvase YqgF  33.83 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0873  Holliday junction resolvase YqgF  33.33 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2024  Holliday junction resolvase YqgF  35.34 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.330713  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0925  Holliday junction resolvase YqgF  31.54 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2633  Holliday junction resolvase-like protein  35 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2479  Holliday junction resolvase-like protein  34.11 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2727  Holliday junction resolvase-like protein  35 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3713  Holliday junction resolvase YqgF  33.59 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0658941  hitchhiker  0.00476179 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1232  Holliday junction resolvase-like protein  35 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2805  Holliday junction resolvase YqgF  33.82 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2570  Holliday junction resolvase YqgF  32.84 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00347975  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0417  Holliday junction resolvase YqgF  28.89 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2202  Holliday junction resolvase-like protein  30.6 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0088  Holliday junction resolvase YqgF  32.59 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1361  Holliday junction resolvase YqgF  30.08 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3633  Holliday junction resolvase YqgF  32.35 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2528  Holliday junction resolvase-like protein  28.89 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.551236  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1942  Holliday junction resolvase-like protein  29.55 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0074  Holliday junction resolvase YqgF  28.36 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.974882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1969  Holliday junction resolvase-like protein  29.55 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0212683 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1714  Holliday junction resolvase-like protein  28.36 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.396791 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2398  Holliday junction resolvase-like protein  30 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0366153  hitchhiker  0.00151496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2514  Holliday junction resolvase-like protein  31.78 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.36708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1790  Holliday junction resolvase YqgF  31.58 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00751815  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4051  Holliday junction resolvase YqgF  29.1 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1518  Holliday junction resolvase-like protein  28.36 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.793177 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2911  Holliday junction resolvase YqgF  31.34 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.816073  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0143  hypothetical protein  25.19 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.906758  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0153  Holliday junction resolvase-like protein  29.08 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0185653  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2739  Holliday junction resolvase YqgF  28.47 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2429  Holliday junction resolvase YqgF  27.34 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1491  Holliday junction resolvase-like protein  29.32 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000748947  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5430  Holliday junction resolvase YqgF  30.88 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2031  Holliday junction resolvase-like protein  28.47 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1748  Holliday junction resolvase-like protein  28.47 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4148  Holliday junction resolvase YqgF  30.3 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0307  Holliday junction resolvase YqgF  29.32 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0873  Holliday junction resolvase YqgF  32.58 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.205729  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4379  Holliday junction resolvase-like protein  30.23 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.556882  normal  0.251804 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1829  Holliday junction resolvase YqgF  32.84 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0551936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3035  Holliday junction resolvase YqgF  33.81 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101605  normal  0.0662243 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2265  Holliday junction resolvase YqgF  31.58 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3225  Holliday junction resolvase YqgF  31.11 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1395  Holliday junction resolvase YqgF  27.21 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2100  Holliday junction resolvase-like protein  31.39 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0938  Holliday junction resolvase YqgF  29.1 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0915  Holliday junction resolvase YqgF  31.06 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.242003  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0059  Holliday junction resolvase-like protein  33.08 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0474  Holliday junction resolvase YqgF  27.66 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00800439  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2004  Holliday junction resolvase-like protein  34.33 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.166059  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2239  Holliday junction resolvase-like protein  24.82 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0014  Holliday junction resolvase YqgF  30.6 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2326  Holliday junction resolvase-like protein  28.46 
 
 		 151 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0635951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1976  Holliday junction resolvase YqgF  31.39 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.133397  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0094  Holliday junction resolvase YqgF  29.23 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0018567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0836  Holliday junction resolvase-like protein  31.06 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311364  hitchhiker  0.00221177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3098  Holliday junction resolvase-like protein  31.06 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51570  predicted protein  30.22 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107223  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0143  Holliday junction resolvase YqgF  30.43 
 
 		 177 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0383  Holliday junction resolvase-like protein  31.06 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0865  Holliday junction resolvase-like protein  31.06 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1327  Holliday junction resolvase-like protein  28.78 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.513618 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3099  Holliday junction resolvase-like protein  29.93 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00212776  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3963  Holliday junction resolvase-like protein  31.82 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0314  Holliday junction resolvase YqgF  29.55 
 
 		 144 aa  52  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1820  Holliday junction resolvase YqgF  31.34 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1903  Holliday junction resolvase YqgF  28.36 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2523  Holliday junction resolvase-like protein  28.46 
 
 		 149 aa  52  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3157  Holliday junction resolvase YqgF  28.12 
 
 		 222 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.588989  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0597  Holliday junction resolvase-like protein  27.82 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2279  Holliday junction resolvase-like protein  32.33 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0061  Holliday junction resolvase YqgF  26.47 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.498043 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0692  Holliday junction resolvase-like protein  26.12 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.458381 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2407  Holliday junction resolvase YqgF  34.06 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.664688  normal  0.90932 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0838  hypothetical protein  29.63 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.115372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2046  Holliday junction resolvase YqgF  36.92 
 
 		 163 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0425259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2047  Holliday junction resolvase YqgF  30.28 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2352  Holliday junction resolvase YqgF  31.82 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.209159 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0056  hypothetical protein  26.47 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1130  Holliday junction resolvase YqgF  27.82 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1336  Holliday junction resolvase-like protein  29.55 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164432  hitchhiker  0.000378103 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0563  Holliday junction resolvase-like protein  27.82 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2406  Holliday junction resolvase YqgF  30.6 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.406379  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2641  Holliday junction resolvase YqgF  30.83 
 
 		 175 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0601  Holliday junction resolvase YqgF  30.93 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.613999 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0348  Holliday junction resolvase YqgF  30.83 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.180305  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>