More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4640 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
307 aa  577  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  98.7 
 
 
307 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.685752 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  95.44 
 
 
307 aa  501  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.36 
 
 
307 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.38 
 
 
306 aa  378  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.046819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.07 
 
 
306 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1480  ABC oligopeptide transporter, inner membrane subunit OppB  58.69 
 
 
307 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.69 
 
 
307 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.591349  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2889  alkaline phosphatase  59.34 
 
 
307 aa  346  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4686  alkaline phosphatase  56.72 
 
 
307 aa  338  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0426131  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.07 
 
 
306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0952742  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0536  oligopeptide ABC transporter, permease protein  57.7 
 
 
307 aa  326  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178861  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0466  oligopeptide ABC transporter, permease protein  57.38 
 
 
307 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3600  alkaline phosphatase  57.7 
 
 
307 aa  325  8.000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.46 
 
 
307 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.63 
 
 
307 aa  315  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2835  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.8 
 
 
307 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0022  alkaline phosphatase  50.49 
 
 
306 aa  311  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.7 
 
 
308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203407  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1986  oligopeptide transporter permease  50.82 
 
 
306 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.879407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2287  oligopeptide transporter permease  50.49 
 
 
306 aa  305  6e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289151  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1404  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  57.38 
 
 
307 aa  305  8.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2194  oligopeptide transporter permease  50.16 
 
 
306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0464785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1953  oligopeptide transporter permease  49.51 
 
 
306 aa  302  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.02 
 
 
306 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.373556 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2301  oligopeptide transporter permease  49.51 
 
 
306 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.52 
 
 
313 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.636778 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1959  oligopeptide transporter permease  50.49 
 
 
306 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2162  oligopeptide transporter permease  50.49 
 
 
306 aa  300  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0136059  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2069  oligopeptide transporter permease  50.16 
 
 
306 aa  298  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.186457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2700  oligopeptide transporter permease  49.84 
 
 
306 aa  296  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0475614  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0610  oligopeptide transporter permease  47.21 
 
 
306 aa  294  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02948  oligopeptide transporter permease  47.87 
 
 
306 aa  293  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1413  oligopeptide transporter permease  49.18 
 
 
306 aa  293  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.933952  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01218  oligopeptide permease ABC transporter membrane protein  49.18 
 
 
306 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1896  oligopeptide transporter permease  49.18 
 
 
306 aa  293  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22801  normal  0.152903 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2404  Alkaline phosphatase  49.18 
 
 
306 aa  293  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000374689  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01228  hypothetical protein  49.18 
 
 
306 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1730  oligopeptide transporter permease  49.18 
 
 
306 aa  293  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  normal  0.0825578 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2384  oligopeptide transporter permease  49.18 
 
 
306 aa  293  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.423477  hitchhiker  0.00000144694 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1353  oligopeptide transporter permease  49.18 
 
 
306 aa  293  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00072076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1392  oligopeptide transporter permease  49.18 
 
 
306 aa  293  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.897764  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1400  oligopeptide transporter permease  49.18 
 
 
306 aa  291  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1582  oligopeptide transporter permease  49.18 
 
 
306 aa  291  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.733786  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1936  oligopeptide transporter permease  49.18 
 
 
306 aa  291  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1873  oligopeptide transporter permease  49.18 
 
 
306 aa  291  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.741835  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2420  nickel-transporting ATPase  50.16 
 
 
305 aa  291  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827843  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1879  oligopeptide transporter permease  49.18 
 
 
306 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675854 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.87 
 
 
311 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.679809  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2029  phosphoglycerate mutase 1  47.87 
 
 
311 aa  285  5.999999999999999e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664114  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002960  oligopeptide transport system permease protein OppB  48.28 
 
 
291 aa  281  9e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0591  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.82 
 
 
308 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.101579  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4405  alkaline phosphatase  45.9 
 
 
306 aa  263  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0756  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, inner membrane subunit  45.02 
 
 
312 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4437  Nickel-transporting ATPase  45.02 
 
 
312 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.856404 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1252  oligopeptide ABC transporter, permease protein  45.34 
 
 
312 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3018  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  45.34 
 
 
312 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2902  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  45.34 
 
 
312 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0918369  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.34 
 
 
312 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0105181 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7029  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  46.25 
 
 
307 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0352  oligopeptide ABC transporter, permease protein  45.02 
 
 
312 aa  255  7e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0386  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  45.02 
 
 
312 aa  255  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49589  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1535  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  45.02 
 
 
312 aa  255  7e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1725  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  45.02 
 
 
312 aa  255  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0116  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  43.73 
 
 
312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.81 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4504  alkaline phosphatase  44.69 
 
 
312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.293278 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2218  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44.69 
 
 
312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.73 
 
 
307 aa  253  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.05 
 
 
312 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.05 
 
 
312 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.05 
 
 
312 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.05 
 
 
312 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.05 
 
 
312 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.32 
 
 
306 aa  248  8e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000961636  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  44.22 
 
 
305 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.87 
 
 
306 aa  246  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000794188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 
305 aa  245  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121257  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  44.55 
 
 
305 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.48 
 
 
307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.298513  hitchhiker  0.00733729 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  40.72 
 
 
305 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003658  oligopeptide ABC transporter permease protein  46.24 
 
 
266 aa  238  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0336  ABC transporter, permease protein  41.83 
 
 
306 aa  236  2e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0225977  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
309 aa  236  4e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000243016  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 
306 aa  235  6e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000653909  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 
306 aa  235  6e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.472252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.92 
 
 
309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.72 
 
 
305 aa  223  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00478237  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.16 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.950379  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 
308 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.28 
 
 
309 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  40.06 
 
 
326 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
307 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.681707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.44 
 
 
333 aa  209  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 
340 aa  209  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0218658  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0149  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.79 
 
 
304 aa  209  6e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.160386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
307 aa  209  6e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1078  oligopeptide ABC transporter, permease  40.93 
 
 
309 aa  209  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>