265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2109 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2109  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 311 aa  624  1e-178  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.762889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0344  cation diffusion facilitator family transporter  43.1 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.178438  normal  0.347458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1971  cation diffusion facilitator family transporter  28 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0981582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4257  cation diffusion facilitator family transporter  27.24 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694554 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  28.96 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  27.66 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  25.33 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  22.6 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  22.34 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  25.82 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  26.37 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  27.17 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  25.75 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  23.02 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  22.38 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  24.26 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  24.24 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  22.64 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  26.44 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  24.81 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  23.79 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  24.81 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  25.93 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  20.94 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  26.39 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  24.54 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  22.97 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  25.67 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  24.23 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  23.37 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  24.66 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  25.67 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  27.5 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  23.37 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  24.43 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  22.52 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  24.73 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  25.3 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  24.11 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  24.06 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  23.95 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  23.51 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  22.73 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  23.51 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  23.79 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  22.37 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  23.61 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  24.9 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  23.16 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  23.19 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  24.25 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  25.77 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  22.08 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  24.56 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  23.94 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  21.72 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  24.56 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  24.56 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  22.59 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  23.4 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  24.34 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  24.48 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  23.86 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  23.02 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  25.1 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  23.9 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  22.18 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  21.59 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  25.55 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  24.81 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  20.88 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  20.22 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  24.92 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  21.93 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  22.83 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  24 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  24.49 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  25.77 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  21.71 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  20.74 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  23.19 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  24.03 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  23.85 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  23.02 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  21.43 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  23.3 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  23.16 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  22.11 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  22.43 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  23.78 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  22.43 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  25.19 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  20.22 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  21.53 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  24.09 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  23.19 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  22.7 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  24.73 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>