More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1971 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1971  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 302 aa  610  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0981582 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0344  cation diffusion facilitator family transporter  24.83 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.178438  normal  0.347458 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2109  cation diffusion facilitator family transporter  28 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.762889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  24.83 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  24.46 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  24.22 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  29.17 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  28.82 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  25.2 
 
 		 311 aa  86.3  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  23.76 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  25.53 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  26.48 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  25.59 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  27.84 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  28.68 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  26.83 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  26.91 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  27.67 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  27.06 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  28.74 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  23.83 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  23.83 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  25.54 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  23.88 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4257  cation diffusion facilitator family transporter  26.67 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694554 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  27.17 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  23.05 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  26.98 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  25.27 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  24.65 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  26.39 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  28.79 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  28.35 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  25.33 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  27.38 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  25.44 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  27.54 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  28.35 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  24.73 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  24.66 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  24.83 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  26.48 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  26.48 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  26.48 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  23.23 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  24.36 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  25.27 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  26.48 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  23.47 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  23.9 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  26.13 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  30.11 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  25.67 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  22.96 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  24.21 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  26.69 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  24.37 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  23.47 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  25.63 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  24.63 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  25.94 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  23.9 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  22.35 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  23.13 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  24.14 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  24 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  25.86 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  25.86 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  25.86 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  28.57 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  24.34 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  24.07 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  25.86 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  24.8 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  26.94 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  25.86 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  26.06 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  25.86 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  23.45 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  25.86 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  24.62 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  25.45 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  23.94 
 
 		 331 aa  67  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  25.48 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  22.59 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  25.1 
 
 		 381 aa  67  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  25 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  23.58 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  25.63 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  27.44 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  27.21 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  25.86 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  24.44 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  29.22 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>