44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4257 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4257  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 308 aa  610  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694554 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0344  cation diffusion facilitator family transporter  28.37 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.178438  normal  0.347458 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2109  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.762889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1971  cation diffusion facilitator family transporter  27.01 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0981582 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  24.66 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  25.1 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  24.75 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  19.93 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  27.59 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  24.91 
 
 		 304 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  26.32 
 
 		 295 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  25.56 
 
 		 483 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  21.4 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  23.44 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  26.55 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  25.27 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  22.8 
 
 		 476 aa  50.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  22.35 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  23.41 
 
 		 298 aa  49.7  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  23.31 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  20.83 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  19.39 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  22.31 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  25.33 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  22.1 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  23.48 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  22.15 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  20.81 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  24.81 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  27.9 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  28.44 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  23.4 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  27.9 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  21.16 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  26.36 
 
 		 462 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  20.74 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  27.59 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  25.47 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  20.77 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  23.94 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  27.98 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  23.23 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  23.97 
 
 		 300 aa  42.7  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  27.54 
 
 		 315 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>