170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0550 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0550  phosphodiesterase  100 
 
 		 509 aa  1009    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl207  phosphodiesterase  57.84 
 
 		 503 aa  552  1e-156  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1091  metal dependent phosphohydrolase  43.53 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000612767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0988  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.24 
 
 		 521 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.549745  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2598  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  39.65 
 
 		 516 aa  368  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000056493  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3371  phosphodiesterase  37.9 
 
 		 519 aa  365  1e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0953  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  38.14 
 
 		 518 aa  364  2e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1625  phosphodiesterase  39.8 
 
 		 508 aa  362  8e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00284901  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1262  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  39.24 
 
 		 509 aa  362  1e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0978  phosphodiesterase  38.34 
 
 		 527 aa  360  4e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0108049  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2207  phosphodiesterase  40.58 
 
 		 518 aa  359  5e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0605  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  38.77 
 
 		 522 aa  359  8e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1309  phosphodiesterase  47.31 
 
 		 505 aa  357  2.9999999999999997e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0124805  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0777  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  36.7 
 
 		 517 aa  355  7.999999999999999e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000796077  normal  0.068248 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1617  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  37.2 
 
 		 510 aa  353  4e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000205751  hitchhiker  0.00000000000531756 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1475  metal dependent phosphohydrolase  42.12 
 
 		 512 aa  353  5e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331031  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1475  metal dependent phosphohydrolase  36.86 
 
 		 515 aa  352  5.9999999999999994e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0039808  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1184  phosphodiesterase  37.57 
 
 		 519 aa  352  1e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.105071 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1337  phosphodiesterase  43.52 
 
 		 540 aa  351  2e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0585  phosphodiesterase  39.05 
 
 		 519 aa  351  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1693  phosphodiesterase  39.09 
 
 		 519 aa  351  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00893236  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1475  metal dependent phosphohydrolase  38.98 
 
 		 487 aa  351  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000182866  normal  0.981892 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1919  phosphodiesterase  37.48 
 
 		 512 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0169953  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1061  phosphodiesterase  37.87 
 
 		 513 aa  350  3e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000060823  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07460  metal dependent phosphohydrolase  38.84 
 
 		 525 aa  350  4e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00487641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0798  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 		 487 aa  350  5e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.164487  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1330  phosphodiesterase  47.63 
 
 		 506 aa  349  6e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3101  phosphodiesterase  37.75 
 
 		 511 aa  349  7e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0679097  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1398  phosphodiesterase  40.27 
 
 		 506 aa  349  8e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.404741  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10740  metal dependent phosphohydrolase  35.35 
 
 		 513 aa  348  2e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.462426  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2430  phosphodiesterase  39.09 
 
 		 520 aa  347  4e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0524  metal dependent phosphohydrolase  38.39 
 
 		 513 aa  346  5e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00240284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1422  phosphodiesterase  38.83 
 
 		 521 aa  346  7e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.008621  normal  0.971465 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1081  metal dependent phosphohydrolase  39.68 
 
 		 504 aa  345  8e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.075195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0083  phosphodiesterase  39.58 
 
 		 517 aa  344  2e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.479038  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1214  phosphodiesterase  38.33 
 
 		 517 aa  344  2.9999999999999997e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11870  metal dependent phosphohydrolase  38.93 
 
 		 514 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000537836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3813  phosphodiesterase  38.52 
 
 		 520 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0688282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1926  phosphodiesterase  38.95 
 
 		 511 aa  342  8e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3877  phosphodiesterase  38.33 
 
 		 520 aa  342  9e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3627  phosphodiesterase  38.52 
 
 		 520 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3519  phosphodiesterase  38.52 
 
 		 520 aa  341  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3537  phosphodiesterase  38.52 
 
 		 520 aa  341  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3914  phosphodiesterase  38.52 
 
 		 520 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00777631  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3825  phosphodiesterase  38.62 
 
 		 521 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3790  phosphodiesterase  38.52 
 
 		 520 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195923 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3549  phosphodiesterase  38.81 
 
 		 521 aa  342  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000213332  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1644  phosphodiesterase  39.64 
 
 		 511 aa  341  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0442  hypothetical protein  41.5 
 
 		 532 aa  341  2e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2578  metal dependent phosphohydrolase  38.26 
 
 		 520 aa  341  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.102064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0715  metal dependent phosphohydrolase  36.9 
 
 		 516 aa  341  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352371  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0615  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 		 558 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22485  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0306  hypothetical protein  39.19 
 
 		 535 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.72936  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0846  phosphodiesterase  37.69 
 
 		 522 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2159  phosphodiesterase  39.63 
 
 		 531 aa  337  2.9999999999999997e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1343  phosphodiesterase  43.94 
 
 		 517 aa  337  3.9999999999999995e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3291  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  36.19 
 
 		 523 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0260994  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1223  phosphodiesterase  43.94 
 
 		 517 aa  337  3.9999999999999995e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1191  phosphodiesterase  38.8 
 
 		 518 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000197151  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0968  phosphodiesterase  36.04 
 
 		 533 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00053282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1425  metal dependent phosphohydrolase  39.17 
 
 		 514 aa  334  3e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.340697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3293  phosphodiesterase  35.15 
 
 		 533 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0502  phosphodiesterase  46.84 
 
 		 517 aa  333  4e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2086  phosphodiesterase  38.61 
 
 		 518 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0520  phosphodiesterase  44.33 
 
 		 517 aa  332  8e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2350  phosphodiesterase  35.89 
 
 		 520 aa  332  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201473  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1120  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  39.22 
 
 		 537 aa  332  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520277  normal  0.168608 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3500  phosphodiesterase  37.73 
 
 		 521 aa  330  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000584399  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1724  phosphodiesterase  37.45 
 
 		 518 aa  329  9e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3248  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 480 aa  329  9e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1160  phosphodiesterase  38.61 
 
 		 510 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1254  HDIG/KH domain-containing protein  38.51 
 
 		 515 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0168178  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0567  metal dependent phosphohydrolase  36.75 
 
 		 509 aa  327  3e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1100  phosphodiesterase  36.6 
 
 		 521 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000238727  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1490  metal dependent phophohydrolase  36.08 
 
 		 527 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3104  phosphodiesterase  37.45 
 
 		 516 aa  326  6e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000128005  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0283  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  38.74 
 
 		 523 aa  326  6e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.333798  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1558  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  38.32 
 
 		 509 aa  326  7e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1608  phosphodiesterase  36.28 
 
 		 527 aa  325  1e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.92092  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0237  hypothetical protein  37.6 
 
 		 509 aa  325  1e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0884  YmdA/YtgF protein  44.44 
 
 		 505 aa  325  2e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0805  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  37.56 
 
 		 501 aa  323  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0515  phosphodiesterase  37.05 
 
 		 510 aa  323  3e-87  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0936  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  40.62 
 
 		 530 aa  323  5e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3711  phosphodiesterase  37.39 
 
 		 510 aa  322  7e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000469244  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1137  phosphodiesterase  35.24 
 
 		 520 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1354  phosphodiesterase  35.59 
 
 		 527 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0856  phosphodiesterase  33.52 
 
 		 535 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000301712  normal  0.0173757 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1346  phosphodiesterase  39.37 
 
 		 519 aa  320  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.66517  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3312  phosphodiesterase  34.56 
 
 		 521 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.924608  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0330  phosphodiesterase  34.22 
 
 		 535 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000340911  decreased coverage  0.00581399 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0788  phosphodiesterase  35.59 
 
 		 522 aa  317  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0940  phosphodiesterase  39.76 
 
 		 507 aa  318  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000513456  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0608  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  35.59 
 
 		 520 aa  318  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000412066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1583  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  37.67 
 
 		 560 aa  318  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1180  phosphodiesterase  35.36 
 
 		 520 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00430196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0962  phosphodiesterase  39.96 
 
 		 507 aa  317  4e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0148724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2218  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  37.05 
 
 		 502 aa  317  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1372  phosphodiesterase  39.17 
 
 		 519 aa  316  6e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800868  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0401  phosphodiesterase  37.3 
 
 		 513 aa  316  8e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>