More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0537 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl533  multidrug ABC transporter  53.93 
 
 
635 aa  644    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0537  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  100 
 
 
617 aa  1254    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.68995  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0538  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  45.11 
 
 
623 aa  445  1e-123  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.033802  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl423  multidrug ABC transporter  43.58 
 
 
614 aa  437  1e-121  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.00524673  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl534  multidrug/protein/lipid ABC transporter ATP-binding component  44.3 
 
 
659 aa  422  1e-117  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.483013  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl422  multidrug ABC transporter  39.39 
 
 
610 aa  412  1e-114  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1949  ABC transporter related  32.58 
 
 
600 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867267  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  32.02 
 
 
579 aa  236  7e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  31.4 
 
 
582 aa  231  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  30.19 
 
 
591 aa  229  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  33.4 
 
 
586 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  31.76 
 
 
580 aa  228  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  31.84 
 
 
676 aa  226  7e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  30.81 
 
 
571 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.81 
 
 
571 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  33.95 
 
 
598 aa  226  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07730  multidrug resistance protein 1, putative  30.42 
 
 
1408 aa  225  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  27.76 
 
 
660 aa  225  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.28 
 
 
571 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.28 
 
 
571 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.28 
 
 
571 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.28 
 
 
571 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.8 
 
 
586 aa  224  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  32.38 
 
 
556 aa  224  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  30.12 
 
 
577 aa  224  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  34.55 
 
 
594 aa  223  7e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.6 
 
 
586 aa  223  7e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.11 
 
 
571 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.11 
 
 
571 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  31.36 
 
 
566 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.54 
 
 
566 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  29.27 
 
 
586 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.4 
 
 
586 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.4 
 
 
586 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.4 
 
 
586 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.6 
 
 
586 aa  221  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.11 
 
 
571 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.2 
 
 
586 aa  220  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  31.85 
 
 
782 aa  220  6e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  29.93 
 
 
571 aa  220  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  33.2 
 
 
586 aa  220  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.2 
 
 
586 aa  220  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  33 
 
 
586 aa  219  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  29.68 
 
 
587 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  33.88 
 
 
578 aa  219  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  31.89 
 
 
584 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.71 
 
 
601 aa  219  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  30.06 
 
 
586 aa  219  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  33.88 
 
 
578 aa  219  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04517  ABC heavy metal ion transporter (Eurofung)  31.3 
 
 
920 aa  218  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.89 
 
 
575 aa  217  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.14 
 
 
578 aa  217  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  31.35 
 
 
777 aa  217  5.9999999999999996e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  28.5 
 
 
572 aa  216  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  32.48 
 
 
601 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  29.13 
 
 
576 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  30 
 
 
638 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3174  ABC transporter related  45.42 
 
 
750 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  30.95 
 
 
764 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  28.65 
 
 
636 aa  214  4.9999999999999996e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  33.73 
 
 
583 aa  213  7e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.81 
 
 
596 aa  213  7.999999999999999e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  28.39 
 
 
568 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3603  ABC transporter related  44.35 
 
 
962 aa  213  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0813652  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  29.66 
 
 
572 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  30.62 
 
 
770 aa  213  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  39.1 
 
 
613 aa  212  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  31.47 
 
 
632 aa  213  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  31.74 
 
 
644 aa  212  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  30.62 
 
 
750 aa  213  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02300  ABC-transporterMultidrug resistance protein MDR ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G1]  30.03 
 
 
1343 aa  211  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.567277  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  34.64 
 
 
602 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  29.11 
 
 
639 aa  211  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  29.52 
 
 
601 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  29.41 
 
 
603 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  29.92 
 
 
615 aa  211  4e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  30.93 
 
 
581 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  29.76 
 
 
598 aa  211  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.71 
 
 
608 aa  210  6e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  30.45 
 
 
608 aa  210  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  31.91 
 
 
589 aa  210  6e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  29.54 
 
 
601 aa  210  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  28.68 
 
 
612 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  30.64 
 
 
618 aa  209  8e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  29.29 
 
 
650 aa  209  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.42 
 
 
572 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  29.36 
 
 
572 aa  209  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  31.36 
 
 
628 aa  208  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  31.83 
 
 
581 aa  208  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  29.78 
 
 
601 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4668  ABC transporter related  28.43 
 
 
593 aa  208  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206506  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  29.39 
 
 
601 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  30.58 
 
 
726 aa  208  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1007  ABC transporter related  31.18 
 
 
784 aa  207  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  28.22 
 
 
582 aa  207  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  28.22 
 
 
582 aa  207  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  30.14 
 
 
626 aa  207  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  29.67 
 
 
575 aa  207  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2254  ABC transporter related  29.75 
 
 
782 aa  206  8e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  29.1 
 
 
606 aa  206  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>