More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01742 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01742  probable acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
586 aa  1214    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0380  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.59 
 
 
596 aa  627  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.86 
 
 
595 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2048  acyl-CoA dehydrogenase, putative  51.41 
 
 
616 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.681425  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5167  Acyl-CoA dehydrogenase-like  50.25 
 
 
598 aa  591  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5930  putative acyl-CoA dehydrogenase  52.51 
 
 
596 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3693  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.17 
 
 
591 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68510  putative acyl-CoA dehydrogenase  52.17 
 
 
596 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0032913  normal  0.251007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0607  putative acyl-CoA dehydrogenase  50 
 
 
598 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06620  putative acyl-CoA dehydrogenase  49.67 
 
 
598 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02316  Acyl-CoA dehydrogenase  47.91 
 
 
599 aa  561  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.254784  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1918  acyl-CoA dehydrogenase-like  46.73 
 
 
600 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.477774  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1177  acyl-CoA dehydrogenase family protein  46.74 
 
 
598 aa  559  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158836  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25210  acyl-CoA dehydrogenase  50 
 
 
591 aa  557  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.885326  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4081  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.26 
 
 
601 aa  553  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0368  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.84 
 
 
601 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335716  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0394  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.84 
 
 
601 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2750  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.49 
 
 
599 aa  550  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000084613  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0398  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.68 
 
 
601 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257074  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1741  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.55 
 
 
594 aa  546  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06600  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.43 
 
 
601 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0606  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.26 
 
 
601 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5170  Acyl-CoA dehydrogenase-like  46.59 
 
 
601 aa  548  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131109  normal  0.317042 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3132  acyl-CoA dehydrogenase family protein  47.72 
 
 
589 aa  546  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45920  acyl-CoA dehydrogenase  47.26 
 
 
601 aa  548  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09630  putative acyl-CoA dehydrogenase  49.24 
 
 
593 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.806665  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4079  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.49 
 
 
592 aa  542  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06640  putative acyl-CoA dehydrogenase  49.66 
 
 
592 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4834  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.51 
 
 
601 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.649579 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1571  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.1 
 
 
601 aa  543  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000982993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0609  putative acyl-CoA dehydrogenase  49.66 
 
 
592 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2431  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  47.91 
 
 
603 aa  542  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2749  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.82 
 
 
596 aa  542  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.59666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0500  acyl-CoA dehydrogenase family protein  46.59 
 
 
601 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.837085  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4681  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  46.26 
 
 
601 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0899  putative acyl-CoA dehydrogenase  49.08 
 
 
593 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183433  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01173  acyl-CoA dehydrogenase  47.83 
 
 
597 aa  535  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.520854  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2039  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.82 
 
 
598 aa  538  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2808  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.52 
 
 
592 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566358  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0912  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.48 
 
 
597 aa  529  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2665  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.98 
 
 
592 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.755851  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0370  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.58 
 
 
592 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0396  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.75 
 
 
592 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352257  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5166  Acyl-CoA dehydrogenase-like  47.66 
 
 
592 aa  528  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3819  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.57 
 
 
590 aa  527  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2777  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.87 
 
 
596 aa  524  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.932954  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0965  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.39 
 
 
597 aa  523  1e-147  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.314138 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0515  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.48 
 
 
591 aa  524  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2368  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.13 
 
 
589 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0400  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.25 
 
 
592 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.672876 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.33 
 
 
595 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.440911  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.55 
 
 
595 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.908056  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4832  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.58 
 
 
592 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0695  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.32 
 
 
595 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.32 
 
 
595 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2410  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.55 
 
 
595 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2330  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.55 
 
 
595 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0680  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.32 
 
 
595 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0564  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.15 
 
 
595 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.33 
 
 
595 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.26 
 
 
598 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.986474  normal  0.238183 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0578  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.93 
 
 
595 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1885  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.92 
 
 
595 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137162  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.55 
 
 
595 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0348  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.76 
 
 
595 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1452  acyl-CoA dehydrogenase-like  44.98 
 
 
597 aa  519  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2109  acyl-CoA dehydrogenase-like  47.33 
 
 
595 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2220  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.79 
 
 
594 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3554  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.62 
 
 
589 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.244117  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4677  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  46.48 
 
 
592 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0983724  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2868  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.41 
 
 
592 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.259312 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0446  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  46.83 
 
 
595 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1754  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.71 
 
 
594 aa  517  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0420795 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3891  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.03 
 
 
606 aa  517  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0363  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.76 
 
 
595 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84094  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.64 
 
 
595 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2639  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.83 
 
 
595 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0601004  normal  0.257028 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6048  Acyl-CoA dehydrogenase-like  46.17 
 
 
599 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0007  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.89 
 
 
596 aa  514  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.419421  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1557  acyl-CoA dehydrogenase-like  43.97 
 
 
593 aa  513  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.538695 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0473  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  47.48 
 
 
595 aa  510  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.390432  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4033  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.15 
 
 
597 aa  510  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795877  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0506  acyl-CoA dehydrogenase family protein  46.14 
 
 
592 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3797  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.76 
 
 
596 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0385  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  46.66 
 
 
595 aa  511  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.13259 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2970  acyl-CoA dehydrogenase-like  43.48 
 
 
591 aa  506  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.108103  normal  0.100369 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0795  acyl-CoA dehydrogenase family protein  44.15 
 
 
597 aa  503  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0815  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.95 
 
 
596 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.809407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0839  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.5 
 
 
592 aa  502  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.704355 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0746  acyl-CoA dehydrogenase family protein  44.15 
 
 
597 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.398029  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0599  acyl-CoA dehydrogenase  43.81 
 
 
597 aa  502  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3101  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.69 
 
 
592 aa  504  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165418  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1408  acyl-CoA dehydrogenase-like  43.73 
 
 
606 aa  504  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0462  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.72 
 
 
597 aa  503  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29438  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3245  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.99 
 
 
596 aa  502  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.532993  normal  0.0328142 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3569  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.82 
 
 
596 aa  501  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.452125 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4038  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase  45.48 
 
 
595 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922091  normal  0.0585748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3278  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.2 
 
 
597 aa  500  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3224  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.85 
 
 
584 aa  497  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2552  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.3 
 
 
596 aa  495  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0690519  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>