More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01678 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01678  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 		 276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1759  HAD family hydrolase  40.58 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0817  HAD family hydrolase  30.39 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0803  HAD-superfamily cof-like hydrolase  29.86 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1482  Cof-like hydrolase  29.59 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00113579  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  28.42 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  27.82 
 
 		 279 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  27.4 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  28.16 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  27.02 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  27.02 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  27.56 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  23.55 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2024  Cof-like hydrolase  25.34 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0205  HAD superfamily hydrolase  25.77 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.855458  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  24.82 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  24.45 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  24.82 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  25.18 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2883  Cof-like hydrolase  25.87 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  28.25 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1689  Cof family protein  25.18 
 
 		 461 aa  72.8  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00487865  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  24.91 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.99 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  26.5 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  25.98 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  23.66 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  26.5 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  25.63 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  25.89 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  25.7 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  27.24 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  28.11 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  28.47 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0497  protein cof  28.47 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  25.61 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  28.94 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  28.47 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0222  putative sugar phosphatase  27.5 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  26.76 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  25 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  25.09 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  25.09 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0559  putative sugar phosphatase  27.14 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3994  putative sugar phosphatase  27.14 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  26.39 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  26.39 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  26.55 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  24.09 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  25.09 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  25.7 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  25.09 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  25.61 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  27.08 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  25 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0596  Cof-like hydrolase  24.15 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0582  Cof-like hydrolase  24.15 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4172  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.1 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0575456  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  26.48 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  26.48 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1851  Cof-like hydrolase  26.67 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  26.48 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  25.61 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  27.08 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3274  Cof protein  23.36 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  23.72 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  27.24 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  25.44 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.29 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  26.9 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0457  Cof-like hydrolase  28.41 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  24.73 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  25.09 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  26.3 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  26.3 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  25.35 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  26.3 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  27.17 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  25.72 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  22.68 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  27.72 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  26.03 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1066  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  23.95 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.840959  normal  0.475939 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  24.57 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  25.95 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4042  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  25.95 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.152006 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  24.64 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2078  HAD superfamily hydrolase  25.27 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  26.99 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  25.95 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  25.95 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  26.13 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0550  Cof-like hydrolase  28.03 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  26.8 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0780  hypothetical protein  24.34 
 
 		 462 aa  62.4  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.680411  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  25.43 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  24.64 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  25.71 
 
 		 275 aa  62  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  24.48 
 
 		 273 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>