More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2078 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_2078  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
276 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0817  HAD family hydrolase  28.87 
 
 
275 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1482  Cof-like hydrolase  29.93 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00113579  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2525  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.39 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000564566  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0803  HAD-superfamily cof-like hydrolase  27.24 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  26.91 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2444  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.96 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.385743 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2261  HAD superfamily hydrolase  27.96 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.839309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2426  HAD superfamily hydrolase  27.96 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2460  HAD superfamily hydrolase  28.67 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00284871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0224  Cof-like hydrolase  26.71 
 
 
290 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0250  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26 
 
 
290 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158966  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  24.45 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  24.09 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.67 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0246  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.16 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  25.99 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  28.41 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.16 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  23.49 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0253  HAD superfamily hydrolase  23.83 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  26.1 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0210  HAD superfamily hydrolase  24.16 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0214  HAD superfamily hydrolase  24.16 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0457  Cof-like hydrolase  29.1 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0213  Cof-like hydrolase  23.83 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13610  hydrolase of the HAD superfamily  40.37 
 
 
161 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2727  Cof-like hydrolase  25.62 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  25.8 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1895  HAD superfamily hydrolase  25.71 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000132103  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  28.42 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  26.22 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  28.79 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  24.73 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  24.45 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  27.53 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2024  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  27.34 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1081  Cof-like hydrolase  45 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00468672  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  26.87 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  28 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2883  Cof-like hydrolase  25.42 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  23.91 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  25.09 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  24.53 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  24.91 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  24.91 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  27.21 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  27.21 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  27.21 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0362  HAD superfamily hydrolase  27.27 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.133771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  27.21 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  27.21 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  27.64 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  27.64 
 
 
281 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  27.21 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  27.21 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  27.21 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  24.38 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  27.64 
 
 
281 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  37.35 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  40.7 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  23.72 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  23.72 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6758  predicted protein  33.12 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.254301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  27.7 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  26.09 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  27.64 
 
 
281 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  25 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0223  haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.27 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  26.26 
 
 
269 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  45.07 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0374  HAD superfamily hydrolase  25.18 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0519666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  27.68 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  25.6 
 
 
273 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.64 
 
 
283 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  26.62 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  26.62 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  26.62 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  24.91 
 
 
272 aa  63.5  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01678  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.27 
 
 
276 aa  63.5  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf242  COF family HAD hydrolase protein  39.19 
 
 
318 aa  63.5  0.000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00196152  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  25.36 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  25.9 
 
 
269 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  23.24 
 
 
274 aa  62.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0900  Cof-like hydrolase  22.47 
 
 
270 aa  63.2  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.183998  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  25.9 
 
 
269 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  27.21 
 
 
273 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  26.98 
 
 
273 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  24.29 
 
 
273 aa  62.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  24.9 
 
 
270 aa  62.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  25.79 
 
 
268 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1451  Cof-like hydrolase  23.91 
 
 
276 aa  62.4  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1728  Cof-like hydrolase  30.08 
 
 
268 aa  62.4  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  25.86 
 
 
274 aa  62  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  24.64 
 
 
266 aa  62.4  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  26.62 
 
 
274 aa  62  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  24.26 
 
 
272 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  26.62 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3074  Cof-like hydrolase  26.16 
 
 
306 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>