More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1482 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1482  Cof-like hydrolase  100 
 
 		 271 aa  555  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00113579  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0803  HAD-superfamily cof-like hydrolase  32.64 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0817  HAD family hydrolase  32.64 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1759  HAD family hydrolase  30.88 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01678  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.59 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2078  HAD superfamily hydrolase  29.93 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3074  Cof-like hydrolase  29.68 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  30.18 
 
 		 266 aa  89  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  27.94 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  29.03 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  29.5 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  28.36 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2261  HAD superfamily hydrolase  30.04 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.839309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2426  HAD superfamily hydrolase  30.04 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.79 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  24.63 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  28.79 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  28.79 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  28.79 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.79 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0222  putative sugar phosphatase  29.82 
 
 		 269 aa  85.9  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3994  putative sugar phosphatase  29.82 
 
 		 269 aa  85.5  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0559  putative sugar phosphatase  29.82 
 
 		 269 aa  85.5  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  29.2 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1043  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  26.42 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  29.2 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  27.65 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  28.36 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2525  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.74 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000564566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2444  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.68 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.385743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  29.2 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  29.2 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  28.99 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  29.2 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  27.31 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  28.89 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  29.2 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  29.2 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  26.92 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.92 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  28.42 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  28.83 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  28.83 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.152006 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1162  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.03 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.352736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  27.11 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2434  Cof protein  25.37 
 
 		 282 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  31.14 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0436  putative HAD superfamily hydrolase  27.89 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.237165  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  25.64 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0365  HAD superfamily hydrolase  28.67 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.231869  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1231  Cof-like hydrolase  28.09 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  28 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  29.45 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  30.8 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2460  HAD superfamily hydrolase  29.5 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00284871  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  28.25 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  25.71 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  26.33 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  28.17 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  26.45 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  29.45 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  24.82 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  24.91 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  25.75 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  26.64 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  26.47 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  26.87 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1851  Cof-like hydrolase  25.29 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  25.09 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  23.25 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  27.9 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.1 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  26.1 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  26.1 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  25 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  26.1 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  27.31 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3662  Cof-like hydrolase  23.19 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309394  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0374  HAD superfamily hydrolase  26.8 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0519666  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13610  hydrolase of the HAD superfamily  37.59 
 
 		 161 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  25.51 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2727  Cof-like hydrolase  28.67 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  28.67 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1081  Cof-like hydrolase  27.41 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00468672  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  27.41 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  26.6 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0900  Cof-like hydrolase  24.63 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.183998  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0525  Cof-like hydrolase  31.82 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  24.07 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  29.67 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  25.09 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  28.32 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  27.01 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  26.39 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  27.64 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  28.78 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  26.74 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  26.81 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>