190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1043 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1043  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  100 
 
 
292 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1482  Cof-like hydrolase  26.42 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00113579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3074  Cof-like hydrolase  24.82 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0803  HAD-superfamily cof-like hydrolase  27.64 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0817  HAD family hydrolase  26.02 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  26.1 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  25.42 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  25.51 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1851  Cof-like hydrolase  22.89 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2879  phosphotransferase  22.68 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0789  phosphotransferase  25.51 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  25.51 
 
 
272 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0900  Cof-like hydrolase  23.11 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.183998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0687  phosphotransferase  25.1 
 
 
272 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028657  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0911  phosphotransferase  25.4 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  24.39 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2876  Cof-like hydrolase  25.51 
 
 
272 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104065  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0820  phosphotransferase  25.4 
 
 
286 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0848  phosphotransferase  25.4 
 
 
286 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2896  phosphotransferase  25.51 
 
 
272 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0306419  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0879  phosphotransferase  25.4 
 
 
286 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0820  phosphotransferase  25.51 
 
 
272 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0934  phosphotransferase  25.4 
 
 
286 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.600795 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  21.74 
 
 
266 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  23.81 
 
 
244 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  23.81 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  24.08 
 
 
272 aa  59.7  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  24.05 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  23.44 
 
 
244 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  22.91 
 
 
273 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  21.17 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  23.08 
 
 
285 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  19.76 
 
 
268 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  22.91 
 
 
273 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  22.13 
 
 
267 aa  56.2  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  19.57 
 
 
268 aa  55.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2434  Cof protein  25.4 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  22.03 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  22.03 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  22.03 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  22.03 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  22.03 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.03 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.03 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  22.62 
 
 
266 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  23.38 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  23.96 
 
 
272 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  26.51 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  22.81 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  22.58 
 
 
265 aa  53.5  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  22.22 
 
 
274 aa  53.1  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.11 
 
 
269 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  21.58 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  24.29 
 
 
274 aa  52.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  22.53 
 
 
275 aa  52.8  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  22.62 
 
 
266 aa  52.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  22.81 
 
 
271 aa  52.8  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.11 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  22.5 
 
 
273 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1895  HAD superfamily hydrolase  24.55 
 
 
278 aa  52  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000132103  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  22.45 
 
 
269 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  22.43 
 
 
271 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0365  HAD superfamily hydrolase  23.86 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.231869  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  23.02 
 
 
265 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  22.4 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  23.58 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1451  Cof-like hydrolase  22.36 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  24.29 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  21.46 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0253  HAD superfamily hydrolase  22.39 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  23.08 
 
 
283 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  25.46 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.78 
 
 
290 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  24.1 
 
 
274 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  24.1 
 
 
274 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0213  Cof-like hydrolase  22.39 
 
 
319 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1180  phosphotransferase  20.85 
 
 
273 aa  49.7  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  22.35 
 
 
268 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  23.29 
 
 
273 aa  49.7  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1231  Cof-like hydrolase  21.72 
 
 
249 aa  49.3  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  25.2 
 
 
266 aa  49.3  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  23.6 
 
 
266 aa  49.3  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  21.72 
 
 
269 aa  49.7  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  22.99 
 
 
283 aa  48.9  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2446  HAD superfamily hydrolase  25.78 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  23.32 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1306  phosphotransferase  24.08 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  22.34 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  22.34 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0214  HAD superfamily hydrolase  22.39 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  22.34 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.74 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0217  Cof-like hydrolase  22.36 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  23.39 
 
 
272 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7133  Cof-like hydrolase  30.99 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.34 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  21.97 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2677  Cof-like hydrolase  25.74 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00196441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3771  Cof-like hydrolase  32.35 
 
 
273 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.540107 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0250  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.39 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>