More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2446 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2446  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
269 aa  551  1e-156  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0783  HAD superfamily hydrolase  41.13 
 
 
269 aa  196  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0247  HAD superfamily hydrolase  36.5 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  26.69 
 
 
273 aa  89.4  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  22.43 
 
 
265 aa  89.4  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  26.85 
 
 
262 aa  86.3  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  26.94 
 
 
270 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0246  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.22 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  28.09 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2352  Cof-like hydrolase  26.32 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  27.11 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0205  HAD superfamily hydrolase  27.87 
 
 
292 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.855458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0210  HAD superfamily hydrolase  27.87 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0457  Cof-like hydrolase  26.26 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0250  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.12 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158966  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6319  putative Cof hydrolase  24 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171761  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0213  Cof-like hydrolase  27.87 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.87 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2883  Cof-like hydrolase  23.78 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0214  HAD superfamily hydrolase  27.87 
 
 
319 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  26.28 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0253  HAD superfamily hydrolase  27.87 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  25.9 
 
 
272 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  24.55 
 
 
270 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0582  Cof-like hydrolase  28.09 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  27.24 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0596  Cof-like hydrolase  28.09 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  26.55 
 
 
277 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1811  Cof-like hydrolase  24.24 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.12 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0224  Cof-like hydrolase  27.87 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  25.62 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  25.99 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  21.25 
 
 
460 aa  79.3  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3662  Cof-like hydrolase  25 
 
 
267 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309394  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2813  Cof protein  26.32 
 
 
278 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  27.92 
 
 
269 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1225  HAD superfamily hydrolase  25.19 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  27.74 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0780  hypothetical protein  23.24 
 
 
462 aa  76.6  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.680411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  23.13 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  24.67 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  26.87 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  27.99 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2024  Cof-like hydrolase  23.83 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  25.1 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  26.04 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  25.48 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  25.93 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  25.93 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  26.32 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  25.93 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  24.44 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  25.99 
 
 
270 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3464  Cof-like hydrolase  26.69 
 
 
267 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  26.24 
 
 
266 aa  72  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  25.82 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  25.82 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  26.01 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  22.76 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  25.56 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  26.84 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  26.84 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  20.99 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  24.81 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3772  Cof-like hydrolase  24.44 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  26.84 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  26.2 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  26.84 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  26.84 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3274  Cof protein  23.33 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  20.99 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  27.04 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  25.82 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  22.22 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1081  Cof-like hydrolase  27.18 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00468672  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  25.83 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  26.94 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1176  HAD superfamily hydrolase  26.47 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.534777  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  26.55 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1689  Cof family protein  23.26 
 
 
461 aa  68.9  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00487865  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  24.45 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3771  Cof-like hydrolase  23.48 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.540107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  25.82 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  24.72 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  24.45 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1629  HAD superfamily hydrolase  28.16 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430499 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  24.45 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.63 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  24.91 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  27.11 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  24.45 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0223  haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.21 
 
 
230 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  24.82 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  24.91 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  21.62 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  24.91 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7133  Cof-like hydrolase  24.16 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  26.74 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>