More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0803 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0803  HAD-superfamily cof-like hydrolase  100 
 
 		 279 aa  552  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0817  HAD family hydrolase  93.45 
 
 		 275 aa  521  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1759  HAD family hydrolase  28.78 
 
 		 273 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1482  Cof-like hydrolase  32.64 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00113579  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01678  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.86 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  30.82 
 
 		 265 aa  96.3  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  26.76 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  23.99 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2078  HAD superfamily hydrolase  27.24 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  24.91 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  24.91 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  24.72 
 
 		 271 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  25.72 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  26.55 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  27.24 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  27.24 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  27.54 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  28.42 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  28.52 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  20.85 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0848  phosphotransferase  22.26 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0457  Cof-like hydrolase  26.67 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0820  phosphotransferase  21.9 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0879  phosphotransferase  21.9 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0934  phosphotransferase  21.9 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.600795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  20.22 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0911  phosphotransferase  21.9 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3074  Cof-like hydrolase  28.4 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  23.24 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  25.09 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  24.11 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0457  Cof-like hydrolase  21.45 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  26.16 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.55 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1274  Cof-like hydrolase  21.6 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442966  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  22.79 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  25.36 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  25.36 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  27.04 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  25.36 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  24.73 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  23.69 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  25.36 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  25 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  25.36 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  20.79 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  28.28 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  25 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1043  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  27.64 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  21.99 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  24.01 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0247  HAD superfamily hydrolase  24.07 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  25.44 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  25 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.152006 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1231  Cof-like hydrolase  27.5 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  22.06 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  25.18 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  25 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1180  phosphotransferase  20.66 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  23.13 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  26.24 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  24.91 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  20.3 
 
 		 265 aa  72  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  24.91 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0823  HAD superfamily hydrolase  27.66 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1298  HAD superfamily hydrolase  25.09 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000863241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  21.79 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  25.36 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  25.09 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  23.55 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  25.45 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  23.55 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  20.86 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  23.17 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  20.86 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0364  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.83 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  22.99 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  23.05 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  21.48 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  28.79 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3662  Cof-like hydrolase  20.07 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309394  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1895  HAD superfamily hydrolase  26.04 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000132103  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  23.19 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3464  Cof-like hydrolase  21.3 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  24.57 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3772  Cof-like hydrolase  20.94 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  27.11 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  23.69 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  22.18 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  26.98 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1954  Cof-like hydrolase  21.86 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6319  putative Cof hydrolase  23.81 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2883  Cof-like hydrolase  22.41 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  19.79 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  26.16 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  25.35 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  25.54 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  24.32 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  21.17 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>