53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5013 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  833    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  88.83 
 
 		 424 aa  676    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  68.93 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  69.02 
 
 		 429 aa  567  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  69.02 
 
 		 422 aa  567  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  71.85 
 
 		 423 aa  535  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  60.86 
 
 		 420 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  51.43 
 
 		 367 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  44.12 
 
 		 400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  50 
 
 		 411 aa  318  9e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  49.14 
 
 		 408 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  48.86 
 
 		 408 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  48.57 
 
 		 408 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  43.92 
 
 		 391 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  44.42 
 
 		 429 aa  300  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  44 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  48.86 
 
 		 402 aa  295  8e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  43.69 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  43.45 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  42.4 
 
 		 392 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  43.62 
 
 		 394 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  41.76 
 
 		 410 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  44.21 
 
 		 369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  43.92 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  40.61 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  37.91 
 
 		 400 aa  250  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  37.44 
 
 		 412 aa  249  5e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  36.72 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  37.92 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  38.1 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  39.88 
 
 		 394 aa  216  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  41.34 
 
 		 393 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  39.29 
 
 		 406 aa  190  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  40.15 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  37.69 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  24.67 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  22.26 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  23.58 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  22.09 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  22.49 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2930  Extracellular ligand-binding receptor  22.92 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0288888  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1454  putative Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  21.64 
 
 		 418 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.689269  hitchhiker  0.00017453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1495  Extracellular ligand-binding receptor  21.64 
 
 		 418 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  25.82 
 
 		 391 aa  46.6  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  22.74 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1798  extracellular ligand-binding receptor  22.67 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3308  extracellular ligand-binding receptor  22.85 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.663851  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3307  extracellular ligand-binding receptor  23.05 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131361 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1679  extracellular ligand-binding receptor  22.62 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2025  Extracellular ligand-binding receptor  22.62 
 
 		 411 aa  43.5  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.718345  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3099  Extracellular ligand-binding receptor  35.43 
 
 		 367 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2931  extracellular ligand-binding receptor  23.61 
 
 		 409 aa  43.1  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.014925  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1797  extracellular ligand-binding receptor  22.77 
 
 		 412 aa  43.1  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>