42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2612 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  843    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  50.96 
 
 		 394 aa  363  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  46.22 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  42.64 
 
 		 402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  40.59 
 
 		 391 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  40.66 
 
 		 367 aa  260  3e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  41.84 
 
 		 410 aa  259  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  41.18 
 
 		 393 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  40.59 
 
 		 400 aa  256  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  41.18 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  41.29 
 
 		 391 aa  252  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  39.61 
 
 		 424 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  40.9 
 
 		 369 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  34.58 
 
 		 422 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  40.78 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  41.82 
 
 		 411 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  34.58 
 
 		 429 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  38.48 
 
 		 395 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  39.09 
 
 		 397 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  33.89 
 
 		 427 aa  245  9e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  39.3 
 
 		 423 aa  243  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  37.13 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  38.12 
 
 		 429 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  37.53 
 
 		 392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  38.91 
 
 		 386 aa  239  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  37.87 
 
 		 408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  39.39 
 
 		 408 aa  233  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  35.87 
 
 		 412 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  32.43 
 
 		 408 aa  232  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  39.09 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  39.34 
 
 		 402 aa  223  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  32.97 
 
 		 405 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  35.22 
 
 		 423 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  33.71 
 
 		 395 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  34.04 
 
 		 400 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  22.02 
 
 		 415 aa  57  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  21.12 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 445 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  20.58 
 
 		 415 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  23.33 
 
 		 432 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1793  hypothetical protein  21.71 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1803  hypothetical protein  21.57 
 
 		 417 aa  46.6  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387974  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>