50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5317 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  840    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  88.83 
 
 		 423 aa  657    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  67.54 
 
 		 422 aa  568  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  67.3 
 
 		 429 aa  567  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  67.38 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  70.05 
 
 		 423 aa  532  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  60.96 
 
 		 420 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  50.85 
 
 		 367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  51.57 
 
 		 411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  50.14 
 
 		 408 aa  319  7e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  49.57 
 
 		 408 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  49 
 
 		 408 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  41.65 
 
 		 400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  44.39 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  43.24 
 
 		 391 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  42.86 
 
 		 410 aa  293  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  47.89 
 
 		 402 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  43.63 
 
 		 429 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  42.78 
 
 		 392 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  45.22 
 
 		 393 aa  288  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  43.08 
 
 		 394 aa  286  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  44.35 
 
 		 395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  44.38 
 
 		 369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  43.09 
 
 		 386 aa  283  5.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  41.76 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  37.88 
 
 		 412 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  38.34 
 
 		 400 aa  256  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  38.48 
 
 		 408 aa  252  7e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  37.53 
 
 		 416 aa  252  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  38.38 
 
 		 405 aa  239  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  39.02 
 
 		 394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  38.51 
 
 		 393 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  39.61 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  40 
 
 		 402 aa  187  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  37.59 
 
 		 391 aa  179  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  23.3 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  24.48 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  22.87 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  22.58 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  22.09 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  23.41 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3307  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3308  extracellular ligand-binding receptor  23.34 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.663851  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2930  Extracellular ligand-binding receptor  23.27 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0288888  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  24.27 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1679  extracellular ligand-binding receptor  23.61 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2025  Extracellular ligand-binding receptor  23.61 
 
 		 411 aa  47  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.718345  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1454  putative Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  23.1 
 
 		 418 aa  46.6  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.689269  hitchhiker  0.00017453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1495  Extracellular ligand-binding receptor  23.1 
 
 		 418 aa  46.6  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1798  extracellular ligand-binding receptor  22.54 
 
 		 411 aa  44.3  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>