36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0483 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  801    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  57.65 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  59.29 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  61.1 
 
 		 369 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  56.7 
 
 		 395 aa  426  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  56.63 
 
 		 393 aa  428  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  50.27 
 
 		 410 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  49.58 
 
 		 400 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  45.55 
 
 		 386 aa  313  4.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  42.86 
 
 		 427 aa  276  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  41.49 
 
 		 412 aa  276  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  42.37 
 
 		 429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  43.14 
 
 		 420 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  42.37 
 
 		 422 aa  272  7e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  40.6 
 
 		 391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  41.76 
 
 		 424 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  41.9 
 
 		 411 aa  259  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  41.95 
 
 		 367 aa  259  9e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  41.48 
 
 		 423 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  42.74 
 
 		 423 aa  256  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  40.97 
 
 		 397 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  41.08 
 
 		 408 aa  245  9e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  41.14 
 
 		 408 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  41.14 
 
 		 408 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  41.19 
 
 		 402 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  40.11 
 
 		 392 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  36.43 
 
 		 400 aa  242  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  35.9 
 
 		 408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  36.99 
 
 		 405 aa  233  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  32.72 
 
 		 416 aa  216  7e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  36.8 
 
 		 402 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  34.99 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  36.02 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  34.31 
 
 		 406 aa  162  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  36.05 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  23.88 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>