36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2258 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  830    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  59.64 
 
 		 408 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  55.14 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  49.04 
 
 		 391 aa  345  6e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  47.8 
 
 		 397 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  46.7 
 
 		 392 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  43.41 
 
 		 386 aa  308  8e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  41.84 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  42.74 
 
 		 410 aa  281  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  41.54 
 
 		 367 aa  280  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  41.62 
 
 		 429 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  41.33 
 
 		 422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  40.46 
 
 		 427 aa  269  7e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  36.87 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  38.5 
 
 		 420 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  38.21 
 
 		 394 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  37.84 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  39.3 
 
 		 424 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  35.62 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  38.02 
 
 		 369 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  37.23 
 
 		 402 aa  252  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  38.62 
 
 		 423 aa  249  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  36.27 
 
 		 395 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  38.44 
 
 		 423 aa  245  8e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  35.89 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  38.9 
 
 		 395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  37.36 
 
 		 408 aa  240  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  37.36 
 
 		 408 aa  239  9e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  36.81 
 
 		 408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  36.45 
 
 		 394 aa  226  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  34.04 
 
 		 416 aa  213  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  37.88 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  37.74 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  36.45 
 
 		 406 aa  190  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  38.36 
 
 		 402 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  23.45 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>