42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2721 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  844    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  75.12 
 
 		 429 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  75.12 
 
 		 422 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  76.79 
 
 		 427 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  70.05 
 
 		 424 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  71.85 
 
 		 423 aa  547  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  57.45 
 
 		 420 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  44.47 
 
 		 400 aa  329  7e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  46.96 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  45.91 
 
 		 408 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  45.33 
 
 		 408 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  45.24 
 
 		 408 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  45.79 
 
 		 411 aa  306  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  46.05 
 
 		 391 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  44.35 
 
 		 397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  44.3 
 
 		 392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  48.45 
 
 		 386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  42.59 
 
 		 393 aa  292  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  42.2 
 
 		 410 aa  287  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  44.94 
 
 		 402 aa  286  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  44.03 
 
 		 395 aa  283  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  44.25 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  44.25 
 
 		 369 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  41.29 
 
 		 429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  42.74 
 
 		 395 aa  263  4.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  38.44 
 
 		 400 aa  249  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  36.87 
 
 		 408 aa  239  9e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  36.89 
 
 		 412 aa  236  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  36.69 
 
 		 405 aa  233  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  33.16 
 
 		 416 aa  233  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  37.24 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  39.38 
 
 		 393 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  37.5 
 
 		 406 aa  191  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  39.6 
 
 		 402 aa  187  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  36.3 
 
 		 391 aa  174  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  24.34 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  21.48 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  20.69 
 
 		 419 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  20.86 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  20.62 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1797  extracellular ligand-binding receptor  23 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>