43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2412 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  803    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  82.14 
 
 		 408 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  81.87 
 
 		 408 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  81.04 
 
 		 408 aa  598  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  72.93 
 
 		 402 aa  510  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  50.41 
 
 		 367 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  48.49 
 
 		 386 aa  335  7.999999999999999e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  49.05 
 
 		 420 aa  332  6e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  48.13 
 
 		 427 aa  332  8e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  48.03 
 
 		 422 aa  328  7e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  47.77 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  51.57 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  49.71 
 
 		 423 aa  316  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  46.94 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  45.79 
 
 		 423 aa  296  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  46.96 
 
 		 397 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  43.68 
 
 		 400 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  46.52 
 
 		 392 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  43.62 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  43.77 
 
 		 410 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  42.82 
 
 		 412 aa  277  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  41.48 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  41.56 
 
 		 393 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  41.9 
 
 		 395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  38.01 
 
 		 408 aa  256  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  41.48 
 
 		 369 aa  256  7e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  39.33 
 
 		 394 aa  256  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  41.82 
 
 		 416 aa  249  8e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  35.56 
 
 		 400 aa  242  9e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  36.11 
 
 		 405 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  41.07 
 
 		 394 aa  206  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  38.48 
 
 		 406 aa  202  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  37.91 
 
 		 402 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  40.91 
 
 		 393 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  40.91 
 
 		 391 aa  182  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  25.25 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  23.85 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  22.15 
 
 		 445 aa  50.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  23.1 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  23.78 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  23.17 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  23.78 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>