37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2846 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  793    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  50.96 
 
 
416 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  49.35 
 
 
406 aa  318  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  43.5 
 
 
402 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  43.66 
 
 
393 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  36.95 
 
 
408 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  42.98 
 
 
391 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  37.36 
 
 
405 aa  247  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  39.88 
 
 
391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  36.45 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  39.1 
 
 
420 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  39.88 
 
 
367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  36.44 
 
 
397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  36.16 
 
 
392 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  37.33 
 
 
429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  38.44 
 
 
400 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  37.06 
 
 
422 aa  233  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  39.02 
 
 
424 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  36.57 
 
 
427 aa  230  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  39.6 
 
 
423 aa  229  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  37.35 
 
 
410 aa  226  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  41.25 
 
 
411 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  39.1 
 
 
386 aa  226  8e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  36.66 
 
 
429 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  39.88 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  39.88 
 
 
408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  36.49 
 
 
412 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  37.87 
 
 
408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  38.17 
 
 
408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  37.83 
 
 
393 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  36.95 
 
 
394 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  37.24 
 
 
369 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  36.66 
 
 
423 aa  209  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  35.48 
 
 
395 aa  206  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  36.24 
 
 
395 aa  203  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  30.39 
 
 
445 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  22.97 
 
 
419 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>