39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1858 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  841    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  56.31 
 
 		 408 aa  466  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  55.14 
 
 		 400 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  43.8 
 
 		 397 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  43.9 
 
 		 392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  43.68 
 
 		 391 aa  311  9e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  42.09 
 
 		 410 aa  285  9e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  41.78 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  38.67 
 
 		 429 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  39.5 
 
 		 367 aa  261  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  38.01 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  36.93 
 
 		 422 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  39.09 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  36.66 
 
 		 429 aa  250  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  36.93 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  38.64 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  38.35 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  37.57 
 
 		 402 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  38.14 
 
 		 420 aa  240  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  38.38 
 
 		 424 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  36.62 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  38.24 
 
 		 423 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  36.99 
 
 		 395 aa  233  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  37.36 
 
 		 394 aa  233  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  36.11 
 
 		 411 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  36.69 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  34.05 
 
 		 412 aa  227  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  36.31 
 
 		 408 aa  226  6e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  35.41 
 
 		 408 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  36.22 
 
 		 408 aa  219  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  32.97 
 
 		 416 aa  219  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  36.76 
 
 		 406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  39.69 
 
 		 393 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  38.78 
 
 		 391 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  39.16 
 
 		 402 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  23.74 
 
 		 432 aa  57  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  22.52 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  24.53 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  23.32 
 
 		 415 aa  43.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>