More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4287 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4287  integrase catalytic region  100 
 
 		 296 aa  598  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1055  integrase catalytic region  100 
 
 		 296 aa  598  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.869774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6408  integrase catalytic region  100 
 
 		 296 aa  598  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6834  Integrase catalytic region  91.23 
 
 		 296 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2520  Integrase catalytic region  52.53 
 
 		 297 aa  318  7e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.820258 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1003  Integrase catalytic region  52.53 
 
 		 297 aa  318  7e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0215255 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1762  Integrase catalytic region  56.8 
 
 		 251 aa  269  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.752527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0556  ISGsu7, transposase OrfB  46.46 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.306375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0761  ISGsu7, transposase OrfB  46.46 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1356  ISGsu7, transposase OrfB  46.46 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.90333  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1848  ISGsu7, transposase OrfB  46.46 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2128  ISGsu7, transposase OrfB  46.46 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2140  ISGsu7, transposase OrfB  46.46 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.746404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2171  ISGsu7, transposase OrfB  46.46 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2279  ISGsu7, transposase OrfB  46.46 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2391  ISGsu7, transposase OrfB  46.46 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3083  ISGsu7, transposase OrfB  46.46 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4319  hypothetical protein  49.15 
 
 		 135 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.458916 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5564  integrase catalytic region  29.58 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.923042  normal  0.135572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5055  integrase catalytic region  29.58 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5094  integrase catalytic region  29.58 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6833  integrase catalytic subunit  29.58 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1930  transposase  29.58 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4975  integrase core subunit  30.21 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  28.57 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4856  integrase catalytic subunit  29.39 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3310  integrase catalytic subunit  29.39 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1830  ISRSO10-transposase ORFB protein  29.71 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.189696  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2331  ISRSO10-transposase ORFB protein  29.35 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0567  ISRSO10-transposase ORFB protein  28.9 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6414  integrase catalytic region  30.47 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  27.21 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1519  Integrase catalytic region  27.35 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  24.65 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  22.74 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  22.74 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  29.97 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  24.65 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  30.55 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  30.55 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  30.55 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  30.55 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  30.55 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  30.55 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  29.97 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  29.97 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  30.55 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  27.23 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  27.23 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  27.23 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  22.38 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  24.65 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  27.23 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  22.38 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  22.38 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  22.38 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  22.38 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  24.65 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  27.53 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  28.43 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  28.43 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  31 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1792  integrase catalytic region  27.6 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540172 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4686  Integrase catalytic region  29.78 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0096  transposase  28.26 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0366  transposase  28.26 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1453  transposase  28.26 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1536  transposase  28.26 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2584  transposase  28.26 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2744  transposase  28.26 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.936564  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4393  integrase catalytic subunit  26.76 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4141  hypothetical protein  26.76 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3934  transposase IS3/IS911 family protein  24.01 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0953  transposase IS3/IS911 family protein  24.01 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3173  transposase IS3/IS911 family protein  24.01 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1444  transposase IS3/IS911 family protein  24.01 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  29.89 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  29.89 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  29.89 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  29.89 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  29.89 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2023  integrase catalytic subunit  25.78 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4251  integrase catalytic region  26.52 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1205  IS2 transposase orfB  26.24 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.83389  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1088  IS2 transposase orfB  26.24 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1668  IS2 transposase orfB  26.24 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.691773 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0110  IS2 transposase orfB  26.24 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.103297  hitchhiker  0.00326457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0399  IS2 transposase orfB  26.24 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1888  IS2 transposase orfB  26.24 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494374 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  28.85 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2765  integrase catalytic subunit  27.37 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189225  normal  0.0315769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2526  integrase catalytic subunit  27.48 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0042  IS2, transposase orfB  26.06 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913232  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0076  IS2, transposase orfB  26.06 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1204  Integrase catalytic region  31 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3181  integrase catalytic subunit  27.4 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  26.36 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4683  integrase catalytic subunit  27.01 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4709  integrase catalytic subunit  27.01 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  24.64 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>