More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1762 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1762  Integrase catalytic region  100 
 
 		 251 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.752527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6408  integrase catalytic region  56.8 
 
 		 296 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4287  integrase catalytic region  56.8 
 
 		 296 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1055  integrase catalytic region  56.8 
 
 		 296 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.869774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6834  Integrase catalytic region  57.74 
 
 		 296 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1003  Integrase catalytic region  51.2 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0215255 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2520  Integrase catalytic region  51.2 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.820258 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0556  ISGsu7, transposase OrfB  43.43 
 
 		 296 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.306375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0761  ISGsu7, transposase OrfB  43.43 
 
 		 296 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1356  ISGsu7, transposase OrfB  43.43 
 
 		 296 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.90333  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1848  ISGsu7, transposase OrfB  43.43 
 
 		 296 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2128  ISGsu7, transposase OrfB  43.43 
 
 		 296 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2140  ISGsu7, transposase OrfB  43.43 
 
 		 296 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.746404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2171  ISGsu7, transposase OrfB  43.43 
 
 		 296 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2279  ISGsu7, transposase OrfB  43.43 
 
 		 296 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2391  ISGsu7, transposase OrfB  43.43 
 
 		 296 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3083  ISGsu7, transposase OrfB  43.43 
 
 		 296 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  27.76 
 
 		 302 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  29.3 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  29.3 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2765  integrase catalytic subunit  28.46 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189225  normal  0.0315769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4683  integrase catalytic subunit  28.46 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4709  integrase catalytic subunit  28.46 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  28.33 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3934  transposase IS3/IS911 family protein  27.94 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580476  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  26.21 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  26.21 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  26.21 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  26.21 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  26.21 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  26.21 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  26.21 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1444  transposase IS3/IS911 family protein  27.94 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3173  transposase IS3/IS911 family protein  27.94 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0953  transposase IS3/IS911 family protein  27.94 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2023  integrase catalytic subunit  29.33 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2526  integrase catalytic subunit  28.08 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4525  integrase catalytic subunit  28.08 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  27.64 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  27.64 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  27.64 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  27.64 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  27.64 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  27.64 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  27.64 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  27.64 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  27.64 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  27.64 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  27.64 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  27.64 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  27.64 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  26.17 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  26.17 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  26.17 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  27.5 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  27.9 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1930  transposase  28.38 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4319  hypothetical protein  48.78 
 
 		 135 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.458916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  28.46 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  27.49 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  27.49 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11780  transposase  27.49 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.89938e-72  hitchhiker  0.00000000193173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  27.49 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  27.49 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5564  integrase catalytic region  27.93 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.923042  normal  0.135572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5055  integrase catalytic region  27.93 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11792  transposase  27.49 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.87208e-50  hitchhiker  0.00000308071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  27.49 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12048  transposase  27.49 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.2114e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11806  transposase  27.49 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.55346e-33  hitchhiker  0.00499729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12381  transposase  27.49 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.55066e-37  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  27.49 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0663  transposase  28.57 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0850  transposase  28.57 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0854  transposase  28.57 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000400672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0884  transposase  28.57 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1036  transposase  28.57 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0036769  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1087  transposase  28.57 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1671  transposase  28.57 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1413  transposase  28.57 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.143794  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11773  transposase  27.49 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.63075e-23  hitchhiker  0.0000000024473 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6833  integrase catalytic subunit  27.93 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12416  transposase  27.49 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.46754e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  27.49 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5094  integrase catalytic region  27.93 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  27.49 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12828  transposase  27.49 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44608e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  26.05 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  24.9 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  28.89 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  28.89 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  24.9 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11348  transposase  27.49 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.0645000000000005e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  26.05 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  26.05 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0188  integrase catalytic region  29.71 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>