More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2520 on replicon NC_013224
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1003  Integrase catalytic region  100 
 
 		 297 aa  624  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0215255 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2520  Integrase catalytic region  100 
 
 		 297 aa  624  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.820258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1055  integrase catalytic region  52.53 
 
 		 296 aa  318  7e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.869774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4287  integrase catalytic region  52.53 
 
 		 296 aa  318  7e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6408  integrase catalytic region  52.53 
 
 		 296 aa  318  7e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6834  Integrase catalytic region  53.33 
 
 		 296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1762  Integrase catalytic region  51.2 
 
 		 251 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.752527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0556  ISGsu7, transposase OrfB  42.81 
 
 		 296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.306375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0761  ISGsu7, transposase OrfB  42.81 
 
 		 296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1356  ISGsu7, transposase OrfB  42.81 
 
 		 296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.90333  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1848  ISGsu7, transposase OrfB  42.81 
 
 		 296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2128  ISGsu7, transposase OrfB  42.81 
 
 		 296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2140  ISGsu7, transposase OrfB  42.81 
 
 		 296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.746404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2171  ISGsu7, transposase OrfB  42.81 
 
 		 296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2279  ISGsu7, transposase OrfB  42.81 
 
 		 296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2391  ISGsu7, transposase OrfB  42.81 
 
 		 296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3083  ISGsu7, transposase OrfB  42.81 
 
 		 296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1519  Integrase catalytic region  28.63 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6414  integrase catalytic region  30.3 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  24.39 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  24.39 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1668  IS2 transposase orfB  25.77 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.691773 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1205  IS2 transposase orfB  25.77 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.83389  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1088  IS2 transposase orfB  25.77 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0399  IS2 transposase orfB  25.77 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1888  IS2 transposase orfB  25.77 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494374 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0110  IS2 transposase orfB  25.77 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.103297  hitchhiker  0.00326457 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  27.72 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1561  insertion element IS2 transposase InsD  24.67 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135849 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0042  IS2, transposase orfB  26.39 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913232  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0076  IS2, transposase orfB  26.39 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1930  transposase  28.57 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0290  IS2 transposase orfB  24.34 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4760  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0655  Integrase catalytic region  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0830  Integrase catalytic region  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1661  Integrase catalytic region  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2243  Integrase catalytic region  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.578947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3245  Integrase catalytic region  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3725  Integrase catalytic region  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  25.98 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0394  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0034  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2145  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2596  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1950  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2613  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0901  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3993  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4144  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4301  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4589  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4646  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1567  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1321  IS2 transposase orfB  26.17 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0920  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0119878  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0990  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1121  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3274  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3225  IS2 transposase orfB  26.17 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3900  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0013  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0859  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0249  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3165  IS2 transposase orfB  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  25.98 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1246  IS2 transposase orfB  26.17 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0408057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4872  insertion element IS2 transposase InsD  26.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4027  IS2 transposase orfB  26.17 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1767  IS2 transposase orfB  26.17 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  27.11 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  27.11 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  27.11 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  27.11 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  27.11 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  27.11 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  27.11 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0237  IS2 transposase orfB  26.17 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.940126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2946  IS2 transposase orfB  26.17 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0002  IS2 transposase orfB  26.17 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1670  IS2 transposase orfB  26.17 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1906  IS2 transposase orfB  26.17 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1732  IS2 transposase orfB  26.17 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2131  IS2 transposase orfB  26.17 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3732  IS2 transposase orfB  26.17 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0011  IS2 transposase orfB  26.17 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2959  IS2 transposase orfB  26.17 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0073  IS2 transposase orfB  26.17 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629539  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2023  integrase catalytic subunit  21.8 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0704  IS2 transposase orfB  25.78 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5055  integrase catalytic region  28.03 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5094  integrase catalytic region  28.03 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5564  integrase catalytic region  28.03 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.923042  normal  0.135572 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6833  integrase catalytic subunit  28.03 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  25.62 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  25.62 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2556  integrase catalytic subunit  30.8 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.369957 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  25.62 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3181  integrase catalytic subunit  28.74 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  25.62 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>