More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6834 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6834  Integrase catalytic region  100 
 
 		 296 aa  597  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4287  integrase catalytic region  91.22 
 
 		 296 aa  545  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1055  integrase catalytic region  91.22 
 
 		 296 aa  545  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.869774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6408  integrase catalytic region  91.22 
 
 		 296 aa  545  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1003  Integrase catalytic region  52.86 
 
 		 297 aa  317  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0215255 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2520  Integrase catalytic region  52.86 
 
 		 297 aa  317  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.820258 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1762  Integrase catalytic region  57.6 
 
 		 251 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.752527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0556  ISGsu7, transposase OrfB  44.44 
 
 		 296 aa  235  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.306375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0761  ISGsu7, transposase OrfB  44.44 
 
 		 296 aa  235  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1356  ISGsu7, transposase OrfB  44.44 
 
 		 296 aa  235  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.90333  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1848  ISGsu7, transposase OrfB  44.44 
 
 		 296 aa  235  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2128  ISGsu7, transposase OrfB  44.44 
 
 		 296 aa  235  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2140  ISGsu7, transposase OrfB  44.44 
 
 		 296 aa  235  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.746404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2171  ISGsu7, transposase OrfB  44.44 
 
 		 296 aa  235  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2279  ISGsu7, transposase OrfB  44.44 
 
 		 296 aa  235  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2391  ISGsu7, transposase OrfB  44.44 
 
 		 296 aa  235  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3083  ISGsu7, transposase OrfB  44.44 
 
 		 296 aa  235  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4319  hypothetical protein  62.2 
 
 		 135 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.458916 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  32.27 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5055  integrase catalytic region  29.57 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6833  integrase catalytic subunit  29.57 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5564  integrase catalytic region  29.57 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.923042  normal  0.135572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5094  integrase catalytic region  29.57 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1930  transposase  31.36 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3310  integrase catalytic subunit  29.83 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4856  integrase catalytic subunit  29.83 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1830  ISRSO10-transposase ORFB protein  29.79 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.189696  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2331  ISRSO10-transposase ORFB protein  29.79 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1519  Integrase catalytic region  27.35 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6414  integrase catalytic region  30.53 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4975  integrase core subunit  28.42 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0110  IS2 transposase orfB  27.57 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.103297  hitchhiker  0.00326457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0399  IS2 transposase orfB  27.57 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1205  IS2 transposase orfB  27.57 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.83389  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1088  IS2 transposase orfB  27.57 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1888  IS2 transposase orfB  27.57 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494374 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1668  IS2 transposase orfB  27.57 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.691773 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4686  Integrase catalytic region  29.78 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0076  IS2, transposase orfB  27.35 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0042  IS2, transposase orfB  27.35 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913232  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0655  Integrase catalytic region  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0830  Integrase catalytic region  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1661  Integrase catalytic region  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1567  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2243  Integrase catalytic region  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.578947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3245  Integrase catalytic region  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3725  Integrase catalytic region  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  25.09 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3993  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1767  IS2 transposase orfB  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0394  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4760  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4589  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2145  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0859  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1950  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4646  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3225  IS2 transposase orfB  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2596  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3274  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4144  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3900  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2613  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4301  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4027  IS2 transposase orfB  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0990  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0013  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0034  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1121  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4872  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0249  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0920  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0119878  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0901  insertion element IS2 transposase InsD  27.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  25.6 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1246  IS2 transposase orfB  27.16 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0408057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1321  IS2 transposase orfB  27.16 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146657  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0567  ISRSO10-transposase ORFB protein  28.15 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2959  IS2 transposase orfB  27.16 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0237  IS2 transposase orfB  27.16 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.940126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3732  IS2 transposase orfB  27.16 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1670  IS2 transposase orfB  27.16 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1732  IS2 transposase orfB  27.16 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2131  IS2 transposase orfB  27.16 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1906  IS2 transposase orfB  27.16 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2946  IS2 transposase orfB  27.16 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4141  hypothetical protein  28.33 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4393  integrase catalytic subunit  28.33 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0073  IS2 transposase orfB  27.16 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629539  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0002  IS2 transposase orfB  27.16 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0011  IS2 transposase orfB  27.16 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3165  IS2 transposase orfB  26.75 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  27.88 
 
 		 231 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  27.88 
 
 		 231 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  26 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  27.88 
 
 		 231 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  27.53 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  26 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  27.88 
 
 		 231 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2584  transposase  28.94 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161826  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4251  integrase catalytic region  26.89 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>