More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1888 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1888  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 301 aa  626  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494374 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1668  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 301 aa  626  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.691773 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0399  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 301 aa  626  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1205  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 301 aa  626  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.83389  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0110  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 301 aa  626  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.103297  hitchhiker  0.00326457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1088  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 301 aa  626  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0042  IS2, transposase orfB  98.68 
 
 		 303 aa  617  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913232  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0076  IS2, transposase orfB  98.68 
 
 		 303 aa  617  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0034  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0655  Integrase catalytic region  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0830  Integrase catalytic region  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1661  Integrase catalytic region  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2243  Integrase catalytic region  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.578947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3245  Integrase catalytic region  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3725  Integrase catalytic region  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3993  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4646  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4589  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4872  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4760  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4301  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4144  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3900  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3165  IS2 transposase orfB  96.01 
 
 		 301 aa  603  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0013  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0249  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0859  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1121  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0920  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0119878  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1567  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2596  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0394  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3274  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2145  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1950  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2613  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0990  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0901  insertion element IS2 transposase InsD  96.35 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0073  IS2 transposase orfB  96.01 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629539  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1670  IS2 transposase orfB  96.01 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1732  IS2 transposase orfB  96.01 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263905  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0237  IS2 transposase orfB  96.01 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.940126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0290  IS2 transposase orfB  96.01 
 
 		 301 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0704  IS2 transposase orfB  96.01 
 
 		 301 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1246  IS2 transposase orfB  96.01 
 
 		 301 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0408057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1906  IS2 transposase orfB  96.01 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2131  IS2 transposase orfB  96.01 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1321  IS2 transposase orfB  96.01 
 
 		 301 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146657  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0002  IS2 transposase orfB  96.01 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2959  IS2 transposase orfB  96.01 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3225  IS2 transposase orfB  95.68 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3732  IS2 transposase orfB  96.01 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0011  IS2 transposase orfB  96.01 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2946  IS2 transposase orfB  96.01 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4027  IS2 transposase orfB  95.68 
 
 		 301 aa  600  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1561  insertion element IS2 transposase InsD  95.35 
 
 		 301 aa  599  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135849 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1767  IS2 transposase orfB  95.68 
 
 		 301 aa  600  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01904  IS2 insertion element transposase InsAB'  95.87 
 
 		 218 aa  441  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2065  Integrase catalytic region  95.87 
 
 		 218 aa  441  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0456907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3631  IS2 transposase orfB  95.63 
 
 		 206 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0086  IS2, transposase orfB, truncation  98.02 
 
 		 223 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0106176  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2331  ISRSO10-transposase ORFB protein  60.41 
 
 		 295 aa  353  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0096  transposase  60.54 
 
 		 295 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0366  transposase  60.54 
 
 		 295 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1453  transposase  60.54 
 
 		 295 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1536  transposase  60.54 
 
 		 295 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2584  transposase  60.54 
 
 		 295 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2744  transposase  60.54 
 
 		 295 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.936564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4356  transposase InsD for insertion element IS2A/D/F/H/I/K  96 
 
 		 183 aa  348  6e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1792  integrase catalytic region  61.51 
 
 		 281 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540172 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1830  ISRSO10-transposase ORFB protein  60.36 
 
 		 282 aa  341  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.189696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1930  transposase  58.97 
 
 		 297 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5094  integrase catalytic region  59.35 
 
 		 278 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5564  integrase catalytic region  59.35 
 
 		 278 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.923042  normal  0.135572 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6833  integrase catalytic subunit  59.35 
 
 		 278 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5055  integrase catalytic region  59.35 
 
 		 278 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0567  ISRSO10-transposase ORFB protein  60.29 
 
 		 282 aa  332  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2605  Integrase catalytic region  62.99 
 
 		 273 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.238238 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4251  integrase catalytic region  55.1 
 
 		 300 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1993  integrase catalytic subunit  58.55 
 
 		 278 aa  320  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.140355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2556  integrase catalytic subunit  58.55 
 
 		 278 aa  320  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.369957 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4856  integrase catalytic subunit  59.58 
 
 		 243 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3310  integrase catalytic subunit  59.58 
 
 		 243 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1435  ISRSO10-transposase ORFB protein  66.67 
 
 		 200 aa  269  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0927886  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0460  ISRSO10-transposase ORFB protein  66.67 
 
 		 200 aa  269  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2024  integrase catalytic subunit  53.44 
 
 		 282 aa  258  7e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0055  integrase catalytic subunit  53.04 
 
 		 282 aa  256  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000315593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0168  integrase catalytic subunit  53.04 
 
 		 282 aa  256  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2174  integrase catalytic subunit  53.04 
 
 		 282 aa  256  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2405  integrase catalytic subunit  53.04 
 
 		 281 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4141  hypothetical protein  47.29 
 
 		 277 aa  242  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4393  integrase catalytic subunit  47.29 
 
 		 277 aa  242  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6582  transposase  55.25 
 
 		 224 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0740  integrase catalytic subunit  46.93 
 
 		 277 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3181  integrase catalytic subunit  48.18 
 
 		 271 aa  228  8e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4643  integrase catalytic region  46.74 
 
 		 275 aa  228  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.623025  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6414  integrase catalytic region  45.45 
 
 		 273 aa  225  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3118  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 147 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301889 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3629  IS2 transposase  93.2 
 
 		 104 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0717  transposase  60.42 
 
 		 235 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>