More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0761 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0556  ISGsu7, transposase OrfB  100 
 
 		 296 aa  615  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.306375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0761  ISGsu7, transposase OrfB  100 
 
 		 296 aa  615  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1356  ISGsu7, transposase OrfB  100 
 
 		 296 aa  615  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.90333  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1848  ISGsu7, transposase OrfB  100 
 
 		 296 aa  615  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2128  ISGsu7, transposase OrfB  100 
 
 		 296 aa  615  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2140  ISGsu7, transposase OrfB  100 
 
 		 296 aa  615  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.746404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2171  ISGsu7, transposase OrfB  100 
 
 		 296 aa  615  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2279  ISGsu7, transposase OrfB  100 
 
 		 296 aa  615  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2391  ISGsu7, transposase OrfB  100 
 
 		 296 aa  615  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3083  ISGsu7, transposase OrfB  100 
 
 		 296 aa  615  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4287  integrase catalytic region  46.46 
 
 		 296 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1055  integrase catalytic region  46.46 
 
 		 296 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.869774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6408  integrase catalytic region  46.46 
 
 		 296 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2520  Integrase catalytic region  42.37 
 
 		 297 aa  255  7e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.820258 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1003  Integrase catalytic region  42.37 
 
 		 297 aa  255  7e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0215255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6834  Integrase catalytic region  44.72 
 
 		 296 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1762  Integrase catalytic region  43.43 
 
 		 251 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.752527  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  27.34 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  27.34 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2023  integrase catalytic subunit  26.43 
 
 		 273 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3686  Integrase catalytic region  27.27 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181009  normal  0.0371116 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1946  integrase catalytic region  25.33 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2163  integrase catalytic region  25.33 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674408  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  28.81 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  28.81 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2285  integrase catalytic region  25.33 
 
 		 271 aa  93.2  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0919  putative transposase protein  28.19 
 
 		 235 aa  92.4  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1888  integrase core subunit  28.19 
 
 		 235 aa  92.4  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1950  integrase core subunit  28.19 
 
 		 229 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00677093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1519  Integrase catalytic region  29.03 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  27.56 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0554  integrase core subunit  28.33 
 
 		 184 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  26.74 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  27.56 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 280 aa  90.1  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 280 aa  90.1  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  27.53 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  27.05 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  27.05 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  27.21 
 
 		 270 aa  89  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  27.21 
 
 		 270 aa  89  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  27.21 
 
 		 270 aa  89  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  27.21 
 
 		 270 aa  89  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  27.21 
 
 		 270 aa  89  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  30.3 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  26.78 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  25.68 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  29.55 
 
 		 295 aa  86.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  29.55 
 
 		 295 aa  86.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  29.55 
 
 		 295 aa  86.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  29.55 
 
 		 295 aa  86.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  29.55 
 
 		 295 aa  86.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  29.85 
 
 		 289 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  29.85 
 
 		 289 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  29.85 
 
 		 289 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  29.21 
 
 		 295 aa  85.9  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  26.37 
 
 		 277 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  29.85 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  29.85 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  26.03 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  26.03 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  26.19 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  26.03 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  26.03 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  26.03 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  26.03 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1309  integrase catalytic subunit  24.05 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3934  transposase IS3/IS911 family protein  25.34 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1444  transposase IS3/IS911 family protein  25.34 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3173  transposase IS3/IS911 family protein  25.34 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  27.15 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0953  transposase IS3/IS911 family protein  25.34 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0597  transposase  26.64 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0684  transposase  26.64 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1167  transposase  26.64 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  27.36 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1797  transposase  26.64 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  29.31 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0399  IS2 transposase orfB  27.86 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1888  IS2 transposase orfB  27.86 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4975  integrase core subunit  25.62 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1205  IS2 transposase orfB  27.86 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.83389  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1668  IS2 transposase orfB  27.86 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.691773 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1088  IS2 transposase orfB  27.86 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0110  IS2 transposase orfB  27.86 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.103297  hitchhiker  0.00326457 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2229  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141221 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  27.36 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1358  integrase catalytic subunit  32.54 
 
 		 208 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278768 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1315  integrase catalytic subunit  32.54 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1295  integrase catalytic subunit  28 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  28 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0076  IS2, transposase orfB  27.76 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0042  IS2, transposase orfB  27.76 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913232  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6125  integrase catalytic region  28.47 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1120  integrase catalytic subunit  32.54 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1053  integrase catalytic subunit  32.54 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0731  integrase catalytic subunit  32.54 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.100278  decreased coverage  0.000000433601 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1928  transposase  26.62 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.406161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1966  transposase  26.64 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1993  transposase  26.64 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>