More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0183 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00099  translocase  43.47 
 
 		 901 aa  669    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  43.47 
 
 		 901 aa  669    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0434  preprotein translocase subunit SecA  40.2 
 
 		 952 aa  642    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  45.47 
 
 		 897 aa  719    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  44.11 
 
 		 911 aa  675    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  41.2 
 
 		 922 aa  639    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  52.9 
 
 		 844 aa  849    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3738  preprotein translocase, SecA subunit  44.74 
 
 		 947 aa  682    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361446  normal  0.764216 
 
 
-
 
NC_002978  WD0549  preprotein translocase subunit SecA  44.12 
 
 		 868 aa  663    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  44.99 
 
 		 934 aa  680    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  54.16 
 
 		 835 aa  872    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  43.88 
 
 		 893 aa  666    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  44.42 
 
 		 862 aa  690    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1687  preprotein translocase subunit SecA  60.87 
 
 		 842 aa  970    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1945  preprotein translocase subunit SecA  45.93 
 
 		 906 aa  683    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.267461  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  42.26 
 
 		 908 aa  665    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4400  preprotein translocase, SecA subunit  44.8 
 
 		 913 aa  678    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0838  preprotein translocase subunit SecA  43.69 
 
 		 788 aa  654    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  54.04 
 
 		 835 aa  874    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0784  preprotein translocase subunit SecA  43.52 
 
 		 787 aa  639    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  54.04 
 
 		 835 aa  873    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl057  preprotein translocase subunit SecA  44.73 
 
 		 943 aa  642    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0786  preprotein translocase subunit SecA  43.69 
 
 		 788 aa  654    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  54.04 
 
 		 835 aa  873    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  45.26 
 
 		 931 aa  707    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  43.73 
 
 		 896 aa  677    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  43.61 
 
 		 896 aa  676    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4094  preprotein translocase subunit SecA  44.44 
 
 		 913 aa  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.843066 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0248  preprotein translocase subunit SecA  43.08 
 
 		 929 aa  656    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  44.82 
 
 		 904 aa  676    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  46.3 
 
 		 968 aa  731    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  43.45 
 
 		 924 aa  660    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0921  preprotein translocase subunit SecA  42.51 
 
 		 862 aa  643    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.895177  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  44.59 
 
 		 923 aa  669    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  45.26 
 
 		 931 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  44.4 
 
 		 903 aa  697    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4428  preprotein translocase subunit SecA  43.74 
 
 		 934 aa  669    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1169  preprotein translocase subunit SecA  44.69 
 
 		 908 aa  695    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  43.76 
 
 		 896 aa  683    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  44.44 
 
 		 932 aa  694    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  45.29 
 
 		 899 aa  719    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  45.57 
 
 		 864 aa  716    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  44.13 
 
 		 910 aa  684    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0882  preprotein translocase subunit SecA  43.69 
 
 		 788 aa  654    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  54.04 
 
 		 835 aa  874    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  44.21 
 
 		 857 aa  686    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  44.41 
 
 		 917 aa  697    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0045  preprotein translocase subunit SecA  45.75 
 
 		 944 aa  658    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0235  preprotein translocase subunit SecA  43.42 
 
 		 896 aa  642    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.373654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  45.57 
 
 		 896 aa  744    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  45.15 
 
 		 930 aa  707    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  41.63 
 
 		 962 aa  653    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0767  preprotein translocase subunit SecA  45.93 
 
 		 994 aa  707    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.42226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1990  preprotein translocase subunit SecA  46.56 
 
 		 911 aa  711    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0232  preprotein translocase, SecA subunit  45.42 
 
 		 804 aa  652    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1149  preprotein translocase subunit SecA  43.22 
 
 		 862 aa  655    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498004  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0289  preprotein translocase subunit SecA  43.42 
 
 		 903 aa  666    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.703701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  44.9 
 
 		 921 aa  700    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  43.81 
 
 		 917 aa  672    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  44.97 
 
 		 908 aa  698    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  45.57 
 
 		 921 aa  714    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  44.8 
 
 		 936 aa  702    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  42.75 
 
 		 907 aa  664    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  43.75 
 
 		 912 aa  679    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0274  preprotein translocase subunit SecA  42.72 
 
 		 926 aa  652    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  44.44 
 
 		 930 aa  669    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2917  preprotein translocase subunit SecA  46.1 
 
 		 895 aa  664    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  44.67 
 
 		 911 aa  692    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  44.78 
 
 		 932 aa  694    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1353  preprotein translocase subunit SecA  46.59 
 
 		 947 aa  682    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  45.21 
 
 		 902 aa  672    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3511  preprotein translocase subunit SecA  44.19 
 
 		 909 aa  685    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00666871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3014  preprotein translocase subunit SecA  45.3 
 
 		 910 aa  686    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  51.02 
 
 		 840 aa  809    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  51.27 
 
 		 845 aa  813    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0990  preprotein translocase subunit SecA  43.1 
 
 		 898 aa  651    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  42.38 
 
 		 908 aa  667    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  42.5 
 
 		 908 aa  669    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  45.15 
 
 		 909 aa  690    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  43.59 
 
 		 906 aa  673    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  48.37 
 
 		 830 aa  768    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2268  protein translocase subunit secA  40.85 
 
 		 955 aa  647    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  44.68 
 
 		 931 aa  695    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  43.99 
 
 		 916 aa  674    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  58.07 
 
 		 865 aa  933    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1321  protein translocase subunit secA  64.55 
 
 		 788 aa  1070    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1331  preprotein translocase subunit SecA  61.67 
 
 		 799 aa  1004    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.313572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0183  protein translocase subunit secA  100 
 
 		 803 aa  1645    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1705  preprotein translocase subunit SecA  60.76 
 
 		 849 aa  966    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2706  preprotein translocase subunit SecA  43.28 
 
 		 912 aa  671    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0684143  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  44.78 
 
 		 932 aa  694    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  48.03 
 
 		 840 aa  739    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  43.77 
 
 		 901 aa  676    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  42.38 
 
 		 908 aa  668    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1759  preprotein translocase subunit SecA  45.31 
 
 		 1009 aa  697    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  44.68 
 
 		 855 aa  675    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  45.52 
 
 		 896 aa  702    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2599  preprotein translocase subunit SecA  44.51 
 
 		 901 aa  665    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.213228  normal  0.874755 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1440  protein translocase subunit secA  45.47 
 
 		 937 aa  676    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  43.38 
 
 		 908 aa  684    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>