More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2415 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2415  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 346 aa  696    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.80536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3739  regulatory protein LacI  36.81 
 
 		 329 aa  164  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160393  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0052  transcriptional regulator, LacI family  35.07 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0448  LacI family transcription regulator  34.5 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1835  LacI family transcription regulator  32.95 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  29.86 
 
 		 362 aa  130  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3194  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 331 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  30.92 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1965  LacI family transcription regulator  31.09 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1855  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  31.09 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  31.56 
 
 		 352 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  31.56 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2994  DNA-binding transcriptional regulator GalS  30.77 
 
 		 332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  29.15 
 
 		 366 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  30.06 
 
 		 329 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3835  LacI family transcription regulator  31.88 
 
 		 329 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3909  LacI family transcription regulator  31.88 
 
 		 329 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2718  LacI family transcription regulator  29.8 
 
 		 347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0935795  normal  0.0852564 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  27.41 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3821  LacI family transcription regulator  31.31 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215608  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1019  LacI family transcription regulator  30.15 
 
 		 340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  29.93 
 
 		 333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1883  LacI family transcription regulator  27.5 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  30.75 
 
 		 343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  28.91 
 
 		 348 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1631  LacI family transcription regulator  28.05 
 
 		 381 aa  112  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213128  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  30.6 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.43 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2529  regulatory protein LacI  30.27 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1608  HTH-type transcriptional regulator GalR  30.15 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.656083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  30.28 
 
 		 352 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3423  transcriptional regulator, LacI family  30.34 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0558625 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  30.06 
 
 		 353 aa  109  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  27.99 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  29.62 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  29.11 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  28.86 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3616  LacI family transcription regulator  30.21 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.427646 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1507  transcriptional regulator, LacI family  29.38 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1497  DNA-binding transcriptional regulator GalS  29.38 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2298  DNA-binding transcriptional regulator GalS  29.38 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335365 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  29.38 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  29.1 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0819  transcriptional regulator, LacI family  31.08 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1667  HTH-type transcriptional regulator GalR  30.47 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02080  DNA-binding transcriptional repressor  30.95 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.451006  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02039  hypothetical protein  30.95 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  31.01 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  27.38 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1286  LacI family transcription regulator  27.22 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000013505  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  30.61 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2894  transcriptional regulator, LacI family  29.83 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1669  HTH-type transcriptional regulator GalR  30.18 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  28.7 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  30.63 
 
 		 353 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1062  DNA-binding transcriptional regulator GalS  28.61 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0795  LacI family transcription regulator  28.45 
 
 		 336 aa  106  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  29.08 
 
 		 346 aa  106  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.62 
 
 		 335 aa  106  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0466  transcriptional regulator, LacI family  28.37 
 
 		 347 aa  106  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1788  HTH-type transcriptional regulator GalR  30.18 
 
 		 335 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  29.86 
 
 		 340 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1610  HTH-type transcriptional regulator GalR  30.18 
 
 		 335 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.578137  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1732  HTH-type transcriptional regulator GalR  30.18 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  29.94 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3173  transcriptional regulator, LacI family  30.17 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.579609 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  29.43 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.87 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  26.42 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1754  transcriptional regulator, LacI family  30.17 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000321603 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  26.84 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2446  DNA-binding transcriptional regulator GalS  29.08 
 
 		 346 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  29.45 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.42 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.27 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  27.5 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2141  LacI family transcription regulator  30.56 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0418584  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  28.35 
 
 		 347 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0755  LacI family transcription regulator  28.2 
 
 		 357 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  31.36 
 
 		 348 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  30.13 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02685  DNA-binding transcriptional repressor  29.06 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0878  DNA-binding transcriptional regulator GalR  29.06 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3025  DNA-binding transcriptional regulator GalR  29.06 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  29.89 
 
 		 351 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02646  hypothetical protein  29.06 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2984  DNA-binding transcriptional regulator GalR  29.06 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3157  DNA-binding transcriptional regulator GalR  29.06 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674454  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1687  LacI family transcription regulator  30.21 
 
 		 360 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.142395 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0853  transcriptional regulator, LacI family  28.77 
 
 		 343 aa  102  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  28.32 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2985  DNA-binding transcriptional regulator GalR  28.77 
 
 		 343 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  26.15 
 
 		 334 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0708  HTH-type transcriptional regulator, LacI family  28.49 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4363  LacI family transcription regulator  27.48 
 
 		 349 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000162438  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  27.3 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0920  LacI family transcription regulator  28.01 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.830745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  28.02 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>