More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0448 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0448  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 328 aa  639    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1835  LacI family transcription regulator  42.72 
 
 		 336 aa  253  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3194  LacI family transcription regulator  45.32 
 
 		 331 aa  248  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2415  transcriptional regulator, LacI family  34.5 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.80536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3739  regulatory protein LacI  39.86 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160393  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0052  transcriptional regulator, LacI family  40.14 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  30.09 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  25.88 
 
 		 341 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  33.85 
 
 		 362 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3835  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 		 329 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3909  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 		 329 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2994  DNA-binding transcriptional regulator GalS  31.44 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  32.82 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  32.52 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3821  LacI family transcription regulator  34.45 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215608  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  35.48 
 
 		 663 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  27.22 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  28.7 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  30.63 
 
 		 353 aa  102  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 349 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  29.26 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.03 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  28.03 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2386  LacI family transcription regulator  31.27 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737452  normal  0.472555 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0466  transcriptional regulator, LacI family  32.86 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002667  Galactose operon repressor  31.75 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03325  transcriptional regulator  31.99 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.08 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1883  LacI family transcription regulator  28.79 
 
 		 351 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0533  LacI family transcription regulator  27.83 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.985534  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3340  LacI family transcription regulator  32.91 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1876  LacI family transcription regulator  27.09 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  34.68 
 
 		 349 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  27.46 
 
 		 334 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.61 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  27.99 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0899  LacI family transcription regulator  28.93 
 
 		 361 aa  96.7  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2559  alanine racemase  32.52 
 
 		 358 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  28.44 
 
 		 332 aa  95.9  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2751  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 		 335 aa  95.9  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  27.9 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  27.99 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.76 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  27.9 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  27.59 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  27.59 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2751  DNA-binding transcriptional regulator GalS  29.39 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2954  DNA-binding transcriptional regulator GalR  30.68 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  27.67 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  27.67 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3832  DNA-binding transcriptional regulator GalR  30.38 
 
 		 339 aa  93.6  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  27.59 
 
 		 332 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  29.18 
 
 		 368 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1096  LacI family transcription regulator  32.69 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  27.59 
 
 		 332 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  25.08 
 
 		 341 aa  93.6  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  31.9 
 
 		 355 aa  93.6  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1849  LacI family transcription regulator  30.92 
 
 		 358 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0321954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  28.74 
 
 		 348 aa  93.2  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1062  DNA-binding transcriptional regulator GalS  28.83 
 
 		 346 aa  92.8  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  32.13 
 
 		 355 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.57 
 
 		 331 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  33.11 
 
 		 346 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  33.11 
 
 		 346 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  29.59 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  30.75 
 
 		 352 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  33.52 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0794  transcriptional regulator, LacI family  33.67 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1111  LacI family transcription regulator  32.69 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1916  LacI family transcription regulator  29.76 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  32.81 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3249  DNA-binding transcriptional regulator GalR  29.02 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735815 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0972  DNA-binding transcriptional regulator GalR  29.02 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3140  transcriptional regulator, LacI family  31.78 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.636128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  29.43 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  26.43 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1025  DNA-binding transcriptional regulator GalR  29.02 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2718  LacI family transcription regulator  31.1 
 
 		 347 aa  90.5  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0935795  normal  0.0852564 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3367  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.6 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00871192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4130  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  34.35 
 
 		 342 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  26.43 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1324  DNA-binding transcriptional regulator GalR  31.19 
 
 		 336 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  33.64 
 
 		 339 aa  89.7  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  29.43 
 
 		 340 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5343  transcriptional regulator, LacI family  33.05 
 
 		 346 aa  89.7  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629268  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  27.11 
 
 		 333 aa  89.4  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03609  transcriptional regulator LacI family  31.82 
 
 		 350 aa  89  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.34339  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  34.2 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1631  LacI family transcription regulator  28.27 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213128  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  32.61 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03674  transcriptional regulator LacI family  32.95 
 
 		 342 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1164  LacI family transcription regulator  28.21 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3350  LacI family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 364 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4014  Alanine racemase  33.02 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.251479 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1304  LacI family transcription regulator  30.48 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  29.13 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4590  LacI family transcription regulator  32.24 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1207  alanine racemase  30.91 
 
 		 339 aa  87.8  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>