More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3835 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3835  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 329 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3909  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 329 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3821  LacI family transcription regulator  99.39 
 
 		 329 aa  649    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215608  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0052  transcriptional regulator, LacI family  38.79 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3739  regulatory protein LacI  37.5 
 
 		 329 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160393  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2415  transcriptional regulator, LacI family  31.88 
 
 		 346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.80536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0448  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3194  LacI family transcription regulator  32.46 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  33.85 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.77 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  31.79 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  30.56 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  28.96 
 
 		 337 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3896  transcriptional regulator, LacI family  32.38 
 
 		 341 aa  96.7  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.469202 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  31.23 
 
 		 352 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  30.95 
 
 		 368 aa  96.3  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1835  LacI family transcription regulator  29.93 
 
 		 336 aa  96.3  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4217  LacI family transcription regulator  33.97 
 
 		 349 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  30.95 
 
 		 384 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  30.96 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  30.79 
 
 		 338 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  29.11 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0056  transcriptional regulator, LacI family  32.15 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3173  transcriptional regulator, LacI family  31.76 
 
 		 342 aa  89.4  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.579609 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.87 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  32.91 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1754  transcriptional regulator, LacI family  31.76 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000321603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2486  ribose operon repressor RbsR  29.76 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008295 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3243  HTH-type transcriptional regulator AscG  29.97 
 
 		 340 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000054765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0249  LacI family transcription regulator  30.25 
 
 		 345 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1311  LacI family transcription regulator  30.75 
 
 		 356 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  30.51 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  28.82 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3344  HTH-type transcriptional regulator AscG  29.97 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.718161  normal  0.0271899 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  26.79 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2529  regulatory protein LacI  30.18 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  30.61 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  29.6 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1038  Alanine racemase  34.06 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255953  normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02810  transcriptional regulator  30.31 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03100  transcriptional regulator, LacI family  31.37 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0219145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0754  transcriptional regulator, LacI family  29.64 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.143705  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  29.25 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1883  LacI family transcription regulator  26.56 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.78 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  31.1 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.23 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3162  HTH-type transcriptional regulator AscG  29.64 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  32.46 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3180  HTH-type transcriptional regulator AscG  29.64 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3228  HTH-type transcriptional regulator AscG  29.64 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000212172 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1164  LacI family transcription regulator  25.87 
 
 		 344 aa  82.4  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  29.65 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  30.9 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  28.19 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29310  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.47 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3698  transcriptional regulator, LacI family  32.95 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375251  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3312  LacI family transcription regulator  27.6 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6733  transcriptional regulator, LacI family  33.22 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1062  DNA-binding transcriptional regulator GalS  28.53 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2535  regulatory protein, LacI  33.97 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228599  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  29.15 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3324  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370251  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  32.31 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  29.41 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  26.6 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  26.88 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  28.84 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4321  transcriptional regulator, LacI family  30.07 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  29.87 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2238  transcriptional regulator, LacI family  27.89 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  28.35 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2434  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.62 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0764  transcriptional regulator, LacI family  29.62 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  27.83 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  29.41 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3366  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.621773  hitchhiker  0.000736287 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3187  LacI family transcription regulator  27.76 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4293  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.41 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.719683 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  28.53 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  28.62 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  28.53 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0777  transcriptional regulator, LacI family  29.17 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000623929 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  27.14 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  28.84 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1273  transcriptional regulator, LacI family  27.94 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.33 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3715  transcriptional regulator, LacI family  29.19 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000372976 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  28.53 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0734  transcriptional regulator, LacI family  27.04 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0116  transcriptional regulator, LacI family  30.56 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  28.53 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3091  LacI family transcription regulator  29.06 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4081  transcriptional regulator, LacI family  30.42 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6854  transcriptional regulator, LacI family  33.79 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000835434  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2715  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.246761  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  26.09 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  30.54 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>