264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0624 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0624  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
116 aa  228  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0738758  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0984  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.21 
 
 
116 aa  147  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709677  hitchhiker  0.00323316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0725  holo-acyl-carrier-protein synthase  60 
 
 
117 aa  144  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00593002  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2911  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.56 
 
 
115 aa  130  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297723  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2620  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.41 
 
 
115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4464  holo-acyl-carrier-protein synthase  54.1 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1014  holo-acyl-carrier-protein synthase  53.28 
 
 
122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207423 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3084  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.14 
 
 
116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.698381  normal  0.879901 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.2 
 
 
122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1139  holo-acyl-carrier-protein synthase  57.02 
 
 
114 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555231  normal  0.266624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2604  holo-acyl-carrier-protein synthase  60.19 
 
 
117 aa  121  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583944  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  54.78 
 
 
119 aa  121  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.55 
 
 
122 aa  120  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4269  holo-acyl-carrier-protein synthase  60.87 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07360  phosphopantethiene--protein transferase  55.17 
 
 
117 aa  113  7.999999999999999e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289254  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0668  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.37 
 
 
119 aa  111  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171073  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29290  phosphopantethiene--protein transferase  63.11 
 
 
116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.843895  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16740  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.47 
 
 
126 aa  108  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1188  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.11 
 
 
135 aa  103  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.884581 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0620  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.43 
 
 
118 aa  100  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.151819  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.97 
 
 
131 aa  92.8  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.52 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0897  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.49 
 
 
116 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.94 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.52 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23180  phosphopantethiene--protein transferase  47.57 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.496529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.07 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.52 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1885  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  38.98 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  42.74 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.1 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.44 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1340  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.71 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  36 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  32.52 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1501  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  39.68 
 
 
128 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109211  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.1 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.19 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  35.48 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.26 
 
 
134 aa  72  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.55 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.77 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2454  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.68 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.87 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_387  holo-(acyl-carrier protein) synthase  37.29 
 
 
119 aa  70.1  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
126 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0445  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  37.29 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.87 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0977  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.07 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000420357  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.38 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.16 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.38 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.38 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.35 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.26 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.61 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.92 
 
 
141 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2253  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.85 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154355  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.62 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.08 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  35.77 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.14 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.38 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.38 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1307  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.19 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0961  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.89 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.88 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.85 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1906  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.25 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0417  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.11 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.25 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3236  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.4 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.209642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.32 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.16 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.38 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  32 
 
 
119 aa  63.5  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1885  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.46 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00392321  normal  0.11013 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0422  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.75 
 
 
119 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.38 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2366  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.89 
 
 
128 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.15 
 
 
126 aa  62.8  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.03 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.81 
 
 
136 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.71 
 
 
126 aa  62  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.51 
 
 
138 aa  62  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.81 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.06 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.52 
 
 
126 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>