More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2868 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  100 
 
 
125 aa  250  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  50 
 
 
134 aa  114  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  49.58 
 
 
134 aa  107  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  42.5 
 
 
125 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.28 
 
 
138 aa  101  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.2 
 
 
131 aa  100  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0445  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  48.31 
 
 
119 aa  100  9e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  48.78 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.8 
 
 
125 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.8 
 
 
125 aa  99.4  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.38 
 
 
126 aa  98.2  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.43 
 
 
132 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.7 
 
 
129 aa  97.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.69 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.86 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.86 
 
 
125 aa  96.7  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_387  holo-(acyl-carrier protein) synthase  47.46 
 
 
119 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0961  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.09 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0422  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.76 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.55 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2138  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.76 
 
 
126 aa  91.3  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.65 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.72 
 
 
125 aa  90.9  5e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.65 
 
 
133 aa  90.1  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.62 
 
 
125 aa  89.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3481  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.73 
 
 
136 aa  89.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  0.0327725 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0271  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.7 
 
 
119 aa  87  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.69 
 
 
126 aa  87  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.7 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.03 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1340  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.49 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.45 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.83 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.1 
 
 
126 aa  84.3  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.83 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.83 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.83 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0568  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.46 
 
 
113 aa  84.3  5e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.9 
 
 
126 aa  84  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.32 
 
 
141 aa  84  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.83 
 
 
126 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.92 
 
 
126 aa  83.6  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.44 
 
 
126 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.44 
 
 
126 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.88 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.16 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  39.2 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  44.83 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0903  holo-acyl-carrier-protein synthase  40 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.59 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.59 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.59 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.38 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  43.59 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.59 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.38 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.59 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.59 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.17 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  44.07 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.1 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  39.06 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  40.16 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.5 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.5 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3236  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.31 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.209642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.98 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.24 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0183  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.7 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.66 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.17 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.58 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1313  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.53 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.15 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2565  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.22 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.9 
 
 
165 aa  77  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.22 
 
 
126 aa  77  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.33 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0235  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.83 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.33 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.16 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.16 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04710  phosphopantethiene--protein transferase  38.58 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.282871  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.16 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.3 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2258  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.5 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.66 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.53 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.26 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1906  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.34 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1067  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.37 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0424191  normal  0.0417111 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.17 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.37 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.34 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1014  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.68 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207423 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09407  Fatty acid synthase, alpha subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78615]  40 
 
 
1860 aa  73.2  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00116938 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0741  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.25 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.125291  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.2 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.37 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>