283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1247 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  100 
 
 
176 aa  354  3.9999999999999996e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  50.98 
 
 
165 aa  160  8.000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  50.33 
 
 
196 aa  148  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04710  phosphopantethiene--protein transferase  49.34 
 
 
179 aa  143  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.282871  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  43.97 
 
 
128 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1885  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  38.98 
 
 
122 aa  99.8  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.18 
 
 
126 aa  97.4  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.68 
 
 
125 aa  97.4  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  40.8 
 
 
128 aa  97.1  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0961  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.61 
 
 
138 aa  95.5  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.34 
 
 
129 aa  94.7  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.05 
 
 
132 aa  94.4  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.02 
 
 
126 aa  94.4  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.72 
 
 
131 aa  93.2  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  37.7 
 
 
125 aa  92  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.5 
 
 
125 aa  91.3  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.5 
 
 
126 aa  91.3  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.5 
 
 
125 aa  90.9  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  40.65 
 
 
126 aa  89.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.02 
 
 
125 aa  89.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.02 
 
 
126 aa  89.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.06 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.23 
 
 
134 aa  89  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2548  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.28 
 
 
131 aa  89  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.65 
 
 
128 aa  88.2  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 
126 aa  88.6  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 
126 aa  87  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.84 
 
 
125 aa  87  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0568  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.9 
 
 
113 aa  87.4  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.62 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.7 
 
 
131 aa  86.7  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.9 
 
 
133 aa  85.9  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.9 
 
 
133 aa  85.9  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0183  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.98 
 
 
143 aa  85.5  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.59 
 
 
126 aa  85.1  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.59 
 
 
126 aa  84.7  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0725  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.84 
 
 
117 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00593002  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  37.7 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2126  holo-[acyl-carrier protein] synthase  39.5 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.77 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.77 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.77 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.77 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.59 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.97 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.77 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1885  holo-acyl-carrier-protein synthase  48.76 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00392321  normal  0.11013 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  80.5  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.32 
 
 
125 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.25 
 
 
126 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.96 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  34.96 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07360  phosphopantethiene--protein transferase  41.82 
 
 
117 aa  80.1  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289254  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.66 
 
 
119 aa  79  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.96 
 
 
126 aa  79  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.52 
 
 
126 aa  79  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.36 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.34 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.25 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.89 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 
125 aa  77  0.0000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0270  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.25 
 
 
119 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 
139 aa  77  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3236  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.1 
 
 
140 aa  77  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.209642 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.71 
 
 
126 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.71 
 
 
126 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1283  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  35.59 
 
 
122 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.329256 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0284  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.25 
 
 
119 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2258  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.8 
 
 
127 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1340  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.07 
 
 
118 aa  77  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.02 
 
 
123 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.59 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0228  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.43 
 
 
119 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1014  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.43 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.59 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.46 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0624  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.71 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0738758  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09407  Fatty acid synthase, alpha subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78615]  38.33 
 
 
1860 aa  75.5  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00116938 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0903  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.71 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1701  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.16 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.092305  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.65 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.66 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.43 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0222  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.43 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0224  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.43 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0250  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.43 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0262  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.43 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.68 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.29 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1139  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.97 
 
 
114 aa  74.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555231  normal  0.266624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.54 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>