More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1260 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 125 aa  259  8e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  96.8 
 
 		 125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  73.6 
 
 		 129 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.6 
 
 		 126 aa  176  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.8 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.87 
 
 		 126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2258  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.2 
 
 		 127 aa  148  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  52.03 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.4 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.6 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.9 
 
 		 141 aa  103  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  41.13 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.28 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.28 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.46 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.8 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  46.34 
 
 		 196 aa  99.4  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.74 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04710  phosphopantethiene--protein transferase  45.97 
 
 		 179 aa  98.6  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.282871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  40.83 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.55 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  44 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.4 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.5 
 
 		 134 aa  94.7  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.8 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  41.94 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1340  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.76 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.74 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.94 
 
 		 132 aa  90.5  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.32 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.34 
 
 		 131 aa  90.1  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.46 
 
 		 126 aa  90.1  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.21 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  38.21 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.08 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.31 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0568  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.9 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.65 
 
 		 126 aa  87.4  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.65 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2126  holo-[acyl-carrier protein] synthase  40 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.4 
 
 		 122 aa  87  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  38.21 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.31 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.54 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.37 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.76 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.37 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.65 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1906  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.8 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.72 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.6 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0183  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.4 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  39.02 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 		 136 aa  83.6  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.7 
 
 		 127 aa  83.6  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.1 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0961  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.5 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0984  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.13 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709677  hitchhiker  0.00323316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1318  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.52 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.5 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4464  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.71 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.32 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0868  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.8 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0432796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1012  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.8 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.84 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2138  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.66 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.2 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1501  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  43.75 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>