298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1144 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
124 aa  248  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.65 
 
 
124 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1701  holo-acyl-carrier-protein synthase  54.92 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.092305  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  52.03 
 
 
123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0280  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.2 
 
 
123 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.346629 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  49.19 
 
 
126 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.58 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.39 
 
 
126 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.39 
 
 
126 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.58 
 
 
126 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.39 
 
 
126 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.39 
 
 
126 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  46.34 
 
 
146 aa  108  3e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.58 
 
 
126 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.58 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.58 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  47.58 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.58 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.34 
 
 
125 aa  107  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.39 
 
 
126 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.77 
 
 
126 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.77 
 
 
126 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.97 
 
 
126 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.97 
 
 
126 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.77 
 
 
126 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.16 
 
 
126 aa  103  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.72 
 
 
126 aa  102  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.77 
 
 
126 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2044  4'-phosphopantetheinyl transferase  49.18 
 
 
123 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.74 
 
 
126 aa  98.6  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  43.55 
 
 
125 aa  98.2  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.65 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.55 
 
 
125 aa  97.1  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.9 
 
 
126 aa  97.1  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.74 
 
 
126 aa  96.7  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.35 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.55 
 
 
126 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.74 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.94 
 
 
126 aa  94.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.74 
 
 
126 aa  94.4  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.55 
 
 
126 aa  94.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.94 
 
 
125 aa  93.6  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.15 
 
 
126 aa  93.6  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.31 
 
 
129 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.94 
 
 
126 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.7 
 
 
134 aa  92  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0235  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.8 
 
 
118 aa  88.6  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.8 
 
 
126 aa  87.8  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.13 
 
 
128 aa  87  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.16 
 
 
138 aa  86.7  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.22 
 
 
142 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.64 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  38.4 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
119 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.16 
 
 
125 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.71 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1404  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  46.03 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1125  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.03 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.617257  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.29 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.98 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.88 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.2 
 
 
125 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2565  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.83 
 
 
120 aa  82  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.93 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0909  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.94 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00194356  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.46 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.17 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.43 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.92 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.6 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.64 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.66 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
133 aa  80.5  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0445  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  37.82 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.33 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.55 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1351  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.03 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0301322  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04710  phosphopantethiene--protein transferase  40.5 
 
 
179 aa  79  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.282871  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.94 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.64 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.15 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0271  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.32 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.66 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1428  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  36.89 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.94 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 
136 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1073  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.02 
 
 
124 aa  77  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.175811  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.17 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.17 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.17 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.17 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5257  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.64 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.907319 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.64 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.69 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0741  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.125291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>