296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1876 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  100 
 
 
125 aa  256  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.4 
 
 
125 aa  111  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.4 
 
 
125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  44 
 
 
129 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  51.22 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2126  holo-[acyl-carrier protein] synthase  46.51 
 
 
127 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  44 
 
 
126 aa  104  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  45.6 
 
 
125 aa  104  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  44 
 
 
126 aa  103  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.02 
 
 
165 aa  101  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0568  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.46 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2138  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.62 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.82 
 
 
176 aa  94  6e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.2 
 
 
126 aa  94  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  42.02 
 
 
196 aa  93.6  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.86 
 
 
131 aa  90.5  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.8 
 
 
123 aa  89.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.62 
 
 
125 aa  89.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04710  phosphopantethiene--protein transferase  40.65 
 
 
179 aa  89.4  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.282871  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.09 
 
 
150 aa  88.2  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.2 
 
 
123 aa  87.8  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.13 
 
 
126 aa  87.8  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.32 
 
 
126 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.32 
 
 
126 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.32 
 
 
126 aa  87.8  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.2 
 
 
126 aa  87.4  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4464  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.9 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.13 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.52 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.13 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  40.34 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.7 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.31 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.13 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.13 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.76 
 
 
136 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.32 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  38.71 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.8 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.94 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0445  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  41.6 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.31 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.48 
 
 
132 aa  84.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.98 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.91 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.94 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.94 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  41.94 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.94 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.94 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.07 
 
 
134 aa  84.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.98 
 
 
136 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.94 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.94 
 
 
126 aa  84  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.77 
 
 
126 aa  83.6  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.94 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.13 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.13 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.09 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.13 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.9 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1906  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.94 
 
 
121 aa  82  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.2 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.48 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.76 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.86 
 
 
136 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.68 
 
 
119 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.76 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4137  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.32 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.9 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.76 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.53 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  38.71 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0183  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.54 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.76 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.53 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_387  holo-(acyl-carrier protein) synthase  40.65 
 
 
119 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  41.13 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.98 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.71 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1701  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.6 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.092305  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.13 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3236  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.1 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.209642 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07360  phosphopantethiene--protein transferase  39.29 
 
 
117 aa  77.4  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289254  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2108  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.8 
 
 
119 aa  77  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.509217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2146  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.8 
 
 
119 aa  77  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0984  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.1 
 
 
116 aa  77  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709677  hitchhiker  0.00323316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.1 
 
 
122 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_002978  WD0814  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.68 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.36 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.01 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0222  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.1 
 
 
119 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0262  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.1 
 
 
119 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>