230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1073 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1073  holo-acyl-carrier-protein synthase  100 
 
 
124 aa  244  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.175811  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0445  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  41.88 
 
 
119 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_387  holo-(acyl-carrier protein) synthase  43.22 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  39.5 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.67 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 
124 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0422  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.32 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1885  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  37.19 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.76 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3236  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.96 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.209642 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.9 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04710  phosphopantethiene--protein transferase  38.66 
 
 
179 aa  70.5  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.282871  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  41.53 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.29 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.83 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1668  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.43 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3481  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.2 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  0.0327725 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.46 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.68 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09407  Fatty acid synthase, alpha subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78615]  35.25 
 
 
1860 aa  67.4  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00116938 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.83 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.83 
 
 
136 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.66 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.7 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.48 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.4 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0961  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.51 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0521  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.04 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000822969  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1906  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.59 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.68 
 
 
134 aa  62.8  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2126  holo-[acyl-carrier protein] synthase  36.97 
 
 
127 aa  62.8  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.77 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.8 
 
 
129 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1313  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.61 
 
 
127 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.13 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.2 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2610  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.31 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1428  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  32.52 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0568  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.62 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.93 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4137  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.98 
 
 
181 aa  61.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.86 
 
 
132 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.4 
 
 
125 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.93 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.83 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.52 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.77 
 
 
125 aa  58.2  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0435  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.4 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.66 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.84 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.35 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.22 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.56 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  41 
 
 
133 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.11 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0962  holo-(acyl-carrier protein) synthase  33.06 
 
 
121 aa  57  0.00000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.539691  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.29 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4464  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.46 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0910  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.98 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.123899  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.92 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1701  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.29 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.092305  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.54 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1327  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.8 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.122179  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.57 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  35 
 
 
196 aa  55.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.12 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.37 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.92 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.26 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  35.83 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.24 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0620  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.9 
 
 
118 aa  53.9  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.151819  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.48 
 
 
119 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0010  holo-[acyl-carrier-protein] synthase (Holo-ACP synthase)  28.8 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.718255  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.89 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.86 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.83 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0138  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.5 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000309691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1885  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.98 
 
 
118 aa  52.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00392321  normal  0.11013 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.16 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.54 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.13 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.09 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.82 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.4 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0984  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.16 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709677  hitchhiker  0.00323316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2138  holo-acyl-carrier-protein synthase  35 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.17 
 
 
126 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.9 
 
 
125 aa  51.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.17 
 
 
126 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  29.66 
 
 
131 aa  51.2  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1318  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.07 
 
 
120 aa  51.2  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1139  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.71 
 
 
114 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555231  normal  0.266624 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
126 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>