More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1884 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
126 aa  261  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  80.8 
 
 
126 aa  215  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  69.6 
 
 
129 aa  186  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.6 
 
 
125 aa  176  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.8 
 
 
125 aa  174  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.84 
 
 
126 aa  140  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  52.89 
 
 
128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2258  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.2 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.72 
 
 
141 aa  108  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  44 
 
 
125 aa  103  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.36 
 
 
132 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.6 
 
 
122 aa  99  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.94 
 
 
134 aa  99  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.98 
 
 
131 aa  98.2  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.6 
 
 
122 aa  98.2  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.54 
 
 
136 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.74 
 
 
125 aa  96.7  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.86 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4464  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.65 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  43.9 
 
 
196 aa  94.7  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.88 
 
 
165 aa  94.7  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1340  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.38 
 
 
118 aa  94  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.4 
 
 
123 aa  93.6  8e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 
126 aa  93.6  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  39.17 
 
 
128 aa  93.6  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 
126 aa  93.6  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1014  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.55 
 
 
122 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207423 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.8 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  38.71 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.28 
 
 
176 aa  92.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.67 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.94 
 
 
124 aa  92  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
136 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.02 
 
 
123 aa  91.3  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 
126 aa  90.9  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.75 
 
 
136 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
136 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04710  phosphopantethiene--protein transferase  40.32 
 
 
179 aa  89.4  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.282871  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
158 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 
126 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
137 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
126 aa  88.6  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.53 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 
126 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 
126 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.6 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0624  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.52 
 
 
116 aa  87.4  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0738758  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0183  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.77 
 
 
143 aa  87.4  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.23 
 
 
139 aa  87  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0984  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.55 
 
 
116 aa  86.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709677  hitchhiker  0.00323316 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 
126 aa  87  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.2 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.2 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  38.71 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.13 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  39.2 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.2 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.2 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.89 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.2 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.2 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.17 
 
 
134 aa  84.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 
135 aa  84  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.1 
 
 
123 aa  83.6  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0725  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.13 
 
 
117 aa  83.6  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00593002  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.76 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  36.59 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  36 
 
 
125 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0568  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.48 
 
 
113 aa  82  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2248  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.28 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.72 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.06 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.46 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.57 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.38 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.4 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  40 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1885  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  37.19 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.44 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.61 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>