294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1003 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  100 
 
 
128 aa  262  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.72 
 
 
129 aa  130  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.89 
 
 
126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.03 
 
 
125 aa  122  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.22 
 
 
125 aa  120  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.41 
 
 
126 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.41 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2258  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.64 
 
 
127 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.35 
 
 
141 aa  100  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.55 
 
 
165 aa  96.3  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.53 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.26 
 
 
131 aa  94.4  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  44 
 
 
196 aa  93.2  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.07 
 
 
132 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.23 
 
 
176 aa  92  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.62 
 
 
138 aa  87.8  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1885  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  38.33 
 
 
122 aa  87.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.1 
 
 
133 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.15 
 
 
123 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.71 
 
 
125 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.19 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04710  phosphopantethiene--protein transferase  41.6 
 
 
179 aa  85.1  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.282871  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.71 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.52 
 
 
126 aa  84  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.1 
 
 
133 aa  83.6  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.37 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.37 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.92 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.2 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0183  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.29 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.48 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.48 
 
 
134 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.8 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.74 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.8 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.5 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0961  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.88 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.65 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.68 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1318  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.14 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.59 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  37.4 
 
 
125 aa  80.1  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.94 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.88 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.42 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.66 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2253  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.93 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154355  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.31 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2138  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.67 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1740  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.36 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  37.19 
 
 
128 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.73 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.8 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1014  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.52 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207423 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  37.19 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.67 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2454  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.46 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 
136 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.52 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1501  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  46.03 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  36 
 
 
119 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.6 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.88 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0984  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.62 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709677  hitchhiker  0.00323316 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1340  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.98 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.02 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.79 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.83 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0010  holo-[acyl-carrier-protein] synthase (Holo-ACP synthase)  33.07 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.718255  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.8 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.94 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.33 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2610  4'-phosphopantetheinyl transferase  43 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1307  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.77 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.25 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0624  4'-phosphopantetheinyl transferase  36 
 
 
116 aa  74.3  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0738758  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3109  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  31.4 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.016377 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.33 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.8 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.13 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.7 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.75 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.43 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.71 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.48 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.54 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0725  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.9 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00593002  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.25 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.89 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0977  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.1 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000420357  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.25 
 
 
126 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.25 
 
 
126 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.43 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.25 
 
 
126 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2638  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.09 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.25 
 
 
126 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2414  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.87 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.48 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.6 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>